Protein–RNA interactions for Protein: B2RUR8

Otud7b, OTU domain-containing protein 7B, mousemouse

Predictions only

Length 840 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otud7bB2RUR8 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Otud7bB2RUR8 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Otud7bB2RUR8 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Otud7bB2RUR8 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Otud7bB2RUR8 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Otud7bB2RUR8 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Otud7bB2RUR8 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Otud7bB2RUR8 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Otud7bB2RUR8 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Otud7bB2RUR8 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Otud7bB2RUR8 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Otud7bB2RUR8 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Otud7bB2RUR8 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Otud7bB2RUR8 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Otud7bB2RUR8 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Otud7bB2RUR8 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Otud7bB2RUR8 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Otud7bB2RUR8 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Otud7bB2RUR8 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Otud7bB2RUR8 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Otud7bB2RUR8 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Otud7bB2RUR8 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Otud7bB2RUR8 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Otud7bB2RUR8 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Otud7bB2RUR8 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Otud7bB2RUR8 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Otud7bB2RUR8 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Otud7bB2RUR8 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Otud7bB2RUR8 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Otud7bB2RUR8 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Otud7bB2RUR8 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Otud7bB2RUR8 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Otud7bB2RUR8 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Otud7bB2RUR8 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Otud7bB2RUR8 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Otud7bB2RUR8 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Otud7bB2RUR8 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Otud7bB2RUR8 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Otud7bB2RUR8 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Otud7bB2RUR8 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Otud7bB2RUR8 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Otud7bB2RUR8 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Otud7bB2RUR8 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Otud7bB2RUR8 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Otud7bB2RUR8 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Otud7bB2RUR8 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Otud7bB2RUR8 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Otud7bB2RUR8 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Otud7bB2RUR8 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Otud7bB2RUR8 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Otud7bB2RUR8 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Otud7bB2RUR8 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Otud7bB2RUR8 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Otud7bB2RUR8 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Otud7bB2RUR8 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Otud7bB2RUR8 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Otud7bB2RUR8 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Otud7bB2RUR8 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Otud7bB2RUR8 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Otud7bB2RUR8 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Otud7bB2RUR8 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Otud7bB2RUR8 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Otud7bB2RUR8 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Otud7bB2RUR8 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Otud7bB2RUR8 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Otud7bB2RUR8 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Otud7bB2RUR8 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Otud7bB2RUR8 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Otud7bB2RUR8 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Otud7bB2RUR8 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Otud7bB2RUR8 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Otud7bB2RUR8 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Otud7bB2RUR8 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Otud7bB2RUR8 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Otud7bB2RUR8 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Otud7bB2RUR8 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Otud7bB2RUR8 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Otud7bB2RUR8 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Otud7bB2RUR8 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Otud7bB2RUR8 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Otud7bB2RUR8 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Otud7bB2RUR8 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Otud7bB2RUR8 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Otud7bB2RUR8 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Otud7bB2RUR8 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Otud7bB2RUR8 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Otud7bB2RUR8 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Otud7bB2RUR8 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Otud7bB2RUR8 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Otud7bB2RUR8 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Otud7bB2RUR8 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Otud7bB2RUR8 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Otud7bB2RUR8 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Otud7bB2RUR8 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Otud7bB2RUR8 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1
Otud7bB2RUR8 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Otud7bB2RUR8 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Otud7bB2RUR8 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Otud7bB2RUR8 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Otud7bB2RUR8 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80.9 ms