Protein–RNA interactions for Protein: B1AVB3

Scml2, Scm polycomb group protein-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 969 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scml2B1AVB3 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Scml2B1AVB3 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Scml2B1AVB3 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Scml2B1AVB3 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Scml2B1AVB3 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Scml2B1AVB3 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Scml2B1AVB3 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Scml2B1AVB3 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Scml2B1AVB3 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Scml2B1AVB3 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Scml2B1AVB3 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Scml2B1AVB3 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Scml2B1AVB3 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Scml2B1AVB3 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Scml2B1AVB3 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Scml2B1AVB3 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Scml2B1AVB3 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Scml2B1AVB3 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Scml2B1AVB3 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Scml2B1AVB3 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Scml2B1AVB3 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Scml2B1AVB3 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Scml2B1AVB3 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Scml2B1AVB3 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Scml2B1AVB3 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Scml2B1AVB3 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Scml2B1AVB3 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Scml2B1AVB3 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Scml2B1AVB3 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Scml2B1AVB3 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Scml2B1AVB3 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Scml2B1AVB3 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Scml2B1AVB3 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Scml2B1AVB3 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Scml2B1AVB3 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Scml2B1AVB3 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Scml2B1AVB3 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Scml2B1AVB3 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Scml2B1AVB3 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Scml2B1AVB3 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Scml2B1AVB3 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Scml2B1AVB3 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Scml2B1AVB3 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Scml2B1AVB3 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Scml2B1AVB3 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Scml2B1AVB3 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Scml2B1AVB3 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Scml2B1AVB3 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Scml2B1AVB3 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Scml2B1AVB3 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Scml2B1AVB3 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Scml2B1AVB3 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Scml2B1AVB3 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Scml2B1AVB3 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Scml2B1AVB3 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Scml2B1AVB3 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Scml2B1AVB3 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Scml2B1AVB3 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Scml2B1AVB3 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Scml2B1AVB3 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Scml2B1AVB3 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Scml2B1AVB3 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Scml2B1AVB3 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Scml2B1AVB3 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Scml2B1AVB3 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Scml2B1AVB3 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Scml2B1AVB3 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Scml2B1AVB3 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Scml2B1AVB3 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Scml2B1AVB3 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Scml2B1AVB3 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Scml2B1AVB3 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Scml2B1AVB3 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Scml2B1AVB3 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Scml2B1AVB3 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Scml2B1AVB3 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Scml2B1AVB3 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Scml2B1AVB3 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Scml2B1AVB3 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Scml2B1AVB3 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Scml2B1AVB3 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Scml2B1AVB3 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Scml2B1AVB3 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Scml2B1AVB3 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Scml2B1AVB3 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Scml2B1AVB3 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Scml2B1AVB3 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Scml2B1AVB3 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Scml2B1AVB3 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Scml2B1AVB3 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Scml2B1AVB3 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Scml2B1AVB3 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Scml2B1AVB3 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Scml2B1AVB3 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Scml2B1AVB3 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Scml2B1AVB3 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Scml2B1AVB3 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Scml2B1AVB3 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Scml2B1AVB3 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Scml2B1AVB3 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms