Protein–RNA interactions for Protein: A2AKG8

Focad, Focadhesin, mousemouse

Predictions only

Length 1,798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FocadA2AKG8 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
FocadA2AKG8 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
FocadA2AKG8 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
FocadA2AKG8 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
FocadA2AKG8 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
FocadA2AKG8 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
FocadA2AKG8 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
FocadA2AKG8 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
FocadA2AKG8 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
FocadA2AKG8 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
FocadA2AKG8 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
FocadA2AKG8 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
FocadA2AKG8 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
FocadA2AKG8 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
FocadA2AKG8 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
FocadA2AKG8 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
FocadA2AKG8 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
FocadA2AKG8 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
FocadA2AKG8 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
FocadA2AKG8 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
FocadA2AKG8 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
FocadA2AKG8 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
FocadA2AKG8 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
FocadA2AKG8 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
FocadA2AKG8 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
FocadA2AKG8 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
FocadA2AKG8 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
FocadA2AKG8 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
FocadA2AKG8 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
FocadA2AKG8 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
FocadA2AKG8 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
FocadA2AKG8 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
FocadA2AKG8 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
FocadA2AKG8 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
FocadA2AKG8 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
FocadA2AKG8 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
FocadA2AKG8 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
FocadA2AKG8 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
FocadA2AKG8 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
FocadA2AKG8 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
FocadA2AKG8 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
FocadA2AKG8 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
FocadA2AKG8 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
FocadA2AKG8 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
FocadA2AKG8 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
FocadA2AKG8 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
FocadA2AKG8 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
FocadA2AKG8 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
FocadA2AKG8 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
FocadA2AKG8 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
FocadA2AKG8 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
FocadA2AKG8 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
FocadA2AKG8 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
FocadA2AKG8 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
FocadA2AKG8 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
FocadA2AKG8 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
FocadA2AKG8 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
FocadA2AKG8 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
FocadA2AKG8 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
FocadA2AKG8 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
FocadA2AKG8 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
FocadA2AKG8 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
FocadA2AKG8 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
FocadA2AKG8 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
FocadA2AKG8 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
FocadA2AKG8 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
FocadA2AKG8 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
FocadA2AKG8 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
FocadA2AKG8 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
FocadA2AKG8 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
FocadA2AKG8 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
FocadA2AKG8 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
FocadA2AKG8 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
FocadA2AKG8 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
FocadA2AKG8 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
FocadA2AKG8 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
FocadA2AKG8 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
FocadA2AKG8 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
FocadA2AKG8 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
FocadA2AKG8 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
FocadA2AKG8 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
FocadA2AKG8 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
FocadA2AKG8 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
FocadA2AKG8 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
FocadA2AKG8 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
FocadA2AKG8 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
FocadA2AKG8 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
FocadA2AKG8 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
FocadA2AKG8 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
FocadA2AKG8 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
FocadA2AKG8 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
FocadA2AKG8 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
FocadA2AKG8 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
FocadA2AKG8 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
FocadA2AKG8 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
FocadA2AKG8 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
FocadA2AKG8 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
FocadA2AKG8 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
FocadA2AKG8 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
FocadA2AKG8 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms