Protein–RNA interactions for Protein: A2A7B5

Prdm2, PR domain-containing 2, with ZNF domain, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm2A2A7B5 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
Prdm2A2A7B5 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Prdm2A2A7B5 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Prdm2A2A7B5 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
Prdm2A2A7B5 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Prdm2A2A7B5 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Prdm2A2A7B5 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Prdm2A2A7B5 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Prdm2A2A7B5 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Prdm2A2A7B5 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Prdm2A2A7B5 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Prdm2A2A7B5 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Prdm2A2A7B5 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Prdm2A2A7B5 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Prdm2A2A7B5 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
Prdm2A2A7B5 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Prdm2A2A7B5 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
Prdm2A2A7B5 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Prdm2A2A7B5 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Prdm2A2A7B5 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Prdm2A2A7B5 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Prdm2A2A7B5 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Prdm2A2A7B5 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Prdm2A2A7B5 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
Prdm2A2A7B5 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Prdm2A2A7B5 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Prdm2A2A7B5 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Prdm2A2A7B5 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Prdm2A2A7B5 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Prdm2A2A7B5 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
Prdm2A2A7B5 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Prdm2A2A7B5 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Prdm2A2A7B5 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
Prdm2A2A7B5 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Prdm2A2A7B5 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Prdm2A2A7B5 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Prdm2A2A7B5 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Prdm2A2A7B5 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
Prdm2A2A7B5 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
Prdm2A2A7B5 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC26.7■■□□□ 1.87
Prdm2A2A7B5 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Prdm2A2A7B5 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Prdm2A2A7B5 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Prdm2A2A7B5 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
Prdm2A2A7B5 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Prdm2A2A7B5 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Prdm2A2A7B5 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Prdm2A2A7B5 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Prdm2A2A7B5 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Prdm2A2A7B5 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Prdm2A2A7B5 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Prdm2A2A7B5 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Prdm2A2A7B5 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Prdm2A2A7B5 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Prdm2A2A7B5 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
Prdm2A2A7B5 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
Prdm2A2A7B5 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Prdm2A2A7B5 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Prdm2A2A7B5 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Prdm2A2A7B5 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Prdm2A2A7B5 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Prdm2A2A7B5 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Prdm2A2A7B5 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Prdm2A2A7B5 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Prdm2A2A7B5 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Prdm2A2A7B5 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
Prdm2A2A7B5 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
Prdm2A2A7B5 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Prdm2A2A7B5 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Prdm2A2A7B5 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Prdm2A2A7B5 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Prdm2A2A7B5 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Prdm2A2A7B5 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Prdm2A2A7B5 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Prdm2A2A7B5 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Prdm2A2A7B5 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Prdm2A2A7B5 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Prdm2A2A7B5 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Prdm2A2A7B5 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Prdm2A2A7B5 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Prdm2A2A7B5 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
Prdm2A2A7B5 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Prdm2A2A7B5 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Prdm2A2A7B5 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Prdm2A2A7B5 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Prdm2A2A7B5 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Prdm2A2A7B5 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC26.64■■□□□ 1.85
Prdm2A2A7B5 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Prdm2A2A7B5 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Prdm2A2A7B5 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.85
Prdm2A2A7B5 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Prdm2A2A7B5 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Prdm2A2A7B5 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Prdm2A2A7B5 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Prdm2A2A7B5 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Prdm2A2A7B5 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Prdm2A2A7B5 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Prdm2A2A7B5 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Prdm2A2A7B5 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Prdm2A2A7B5 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms