Protein–RNA interactions for Protein: A0A0U1RNP2

Uncharacterized protein (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 1,173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A0U1RNP2 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
A0A0U1RNP2 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
A0A0U1RNP2 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
A0A0U1RNP2 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
A0A0U1RNP2 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
A0A0U1RNP2 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
A0A0U1RNP2 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
A0A0U1RNP2 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
A0A0U1RNP2 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
A0A0U1RNP2 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
A0A0U1RNP2 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
A0A0U1RNP2 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
A0A0U1RNP2 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
A0A0U1RNP2 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
A0A0U1RNP2 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
A0A0U1RNP2 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
A0A0U1RNP2 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
A0A0U1RNP2 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
A0A0U1RNP2 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
A0A0U1RNP2 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
A0A0U1RNP2 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
A0A0U1RNP2 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
A0A0U1RNP2 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
A0A0U1RNP2 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
A0A0U1RNP2 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
A0A0U1RNP2 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
A0A0U1RNP2 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
A0A0U1RNP2 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
A0A0U1RNP2 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
A0A0U1RNP2 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
A0A0U1RNP2 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
A0A0U1RNP2 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
A0A0U1RNP2 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
A0A0U1RNP2 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
A0A0U1RNP2 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
A0A0U1RNP2 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
A0A0U1RNP2 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
A0A0U1RNP2 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
A0A0U1RNP2 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
A0A0U1RNP2 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
A0A0U1RNP2 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
A0A0U1RNP2 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
A0A0U1RNP2 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
A0A0U1RNP2 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
A0A0U1RNP2 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
A0A0U1RNP2 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
A0A0U1RNP2 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
A0A0U1RNP2 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
A0A0U1RNP2 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
A0A0U1RNP2 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
A0A0U1RNP2 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
A0A0U1RNP2 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
A0A0U1RNP2 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
A0A0U1RNP2 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
A0A0U1RNP2 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
A0A0U1RNP2 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
A0A0U1RNP2 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
A0A0U1RNP2 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
A0A0U1RNP2 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
A0A0U1RNP2 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
A0A0U1RNP2 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
A0A0U1RNP2 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
A0A0U1RNP2 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
A0A0U1RNP2 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
A0A0U1RNP2 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
A0A0U1RNP2 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
A0A0U1RNP2 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
A0A0U1RNP2 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
A0A0U1RNP2 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
A0A0U1RNP2 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
A0A0U1RNP2 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
A0A0U1RNP2 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
A0A0U1RNP2 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
A0A0U1RNP2 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
A0A0U1RNP2 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
A0A0U1RNP2 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
A0A0U1RNP2 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
A0A0U1RNP2 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
A0A0U1RNP2 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
A0A0U1RNP2 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
A0A0U1RNP2 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
A0A0U1RNP2 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
A0A0U1RNP2 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
A0A0U1RNP2 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
A0A0U1RNP2 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
A0A0U1RNP2 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
A0A0U1RNP2 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
A0A0U1RNP2 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
A0A0U1RNP2 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
A0A0U1RNP2 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
A0A0U1RNP2 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
A0A0U1RNP2 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
A0A0U1RNP2 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
A0A0U1RNP2 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
A0A0U1RNP2 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
A0A0U1RNP2 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
A0A0U1RNP2 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
A0A0U1RNP2 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
A0A0U1RNP2 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
A0A0U1RNP2 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81.7 ms