Protein–RNA interactions for Protein: T1NXB5

Vstm4, V-set and transmembrane domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vstm4T1NXB5 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Vstm4T1NXB5 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Vstm4T1NXB5 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Vstm4T1NXB5 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Vstm4T1NXB5 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Vstm4T1NXB5 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Vstm4T1NXB5 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Vstm4T1NXB5 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Vstm4T1NXB5 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Vstm4T1NXB5 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Vstm4T1NXB5 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Vstm4T1NXB5 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Vstm4T1NXB5 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Vstm4T1NXB5 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Vstm4T1NXB5 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Vstm4T1NXB5 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Vstm4T1NXB5 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Vstm4T1NXB5 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Vstm4T1NXB5 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Vstm4T1NXB5 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Vstm4T1NXB5 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Vstm4T1NXB5 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Vstm4T1NXB5 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Vstm4T1NXB5 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Vstm4T1NXB5 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Vstm4T1NXB5 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Vstm4T1NXB5 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
Vstm4T1NXB5 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Vstm4T1NXB5 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Vstm4T1NXB5 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Vstm4T1NXB5 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Vstm4T1NXB5 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Vstm4T1NXB5 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Vstm4T1NXB5 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Vstm4T1NXB5 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Vstm4T1NXB5 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Vstm4T1NXB5 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Vstm4T1NXB5 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Vstm4T1NXB5 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Vstm4T1NXB5 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Vstm4T1NXB5 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Vstm4T1NXB5 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Vstm4T1NXB5 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Vstm4T1NXB5 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Vstm4T1NXB5 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Vstm4T1NXB5 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Vstm4T1NXB5 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Vstm4T1NXB5 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Vstm4T1NXB5 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Vstm4T1NXB5 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Vstm4T1NXB5 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Vstm4T1NXB5 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Vstm4T1NXB5 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Vstm4T1NXB5 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Vstm4T1NXB5 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Vstm4T1NXB5 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Vstm4T1NXB5 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Vstm4T1NXB5 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Vstm4T1NXB5 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Vstm4T1NXB5 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Vstm4T1NXB5 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Vstm4T1NXB5 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Vstm4T1NXB5 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Vstm4T1NXB5 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Vstm4T1NXB5 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Vstm4T1NXB5 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Vstm4T1NXB5 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Vstm4T1NXB5 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Vstm4T1NXB5 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Vstm4T1NXB5 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Vstm4T1NXB5 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Vstm4T1NXB5 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Vstm4T1NXB5 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Vstm4T1NXB5 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Vstm4T1NXB5 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Vstm4T1NXB5 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Vstm4T1NXB5 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Vstm4T1NXB5 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Vstm4T1NXB5 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Vstm4T1NXB5 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Vstm4T1NXB5 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Vstm4T1NXB5 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Vstm4T1NXB5 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Vstm4T1NXB5 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Vstm4T1NXB5 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Vstm4T1NXB5 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Vstm4T1NXB5 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Vstm4T1NXB5 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Vstm4T1NXB5 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Vstm4T1NXB5 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Vstm4T1NXB5 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC20.58■□□□□ 0.88
Vstm4T1NXB5 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Vstm4T1NXB5 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Vstm4T1NXB5 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Vstm4T1NXB5 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Vstm4T1NXB5 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Vstm4T1NXB5 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Vstm4T1NXB5 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Vstm4T1NXB5 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Vstm4T1NXB5 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.6 ms