Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2Y3

Homer1, Homer protein homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Homer1Q9Z2Y3 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Homer1Q9Z2Y3 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Homer1Q9Z2Y3 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Homer1Q9Z2Y3 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Homer1Q9Z2Y3 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Homer1Q9Z2Y3 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Homer1Q9Z2Y3 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Homer1Q9Z2Y3 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Homer1Q9Z2Y3 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Homer1Q9Z2Y3 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Homer1Q9Z2Y3 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Homer1Q9Z2Y3 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Homer1Q9Z2Y3 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Homer1Q9Z2Y3 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Homer1Q9Z2Y3 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Homer1Q9Z2Y3 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Homer1Q9Z2Y3 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Homer1Q9Z2Y3 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Homer1Q9Z2Y3 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Homer1Q9Z2Y3 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Homer1Q9Z2Y3 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Homer1Q9Z2Y3 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Homer1Q9Z2Y3 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Homer1Q9Z2Y3 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Homer1Q9Z2Y3 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Homer1Q9Z2Y3 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Homer1Q9Z2Y3 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Homer1Q9Z2Y3 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Homer1Q9Z2Y3 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Homer1Q9Z2Y3 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Homer1Q9Z2Y3 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Homer1Q9Z2Y3 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Homer1Q9Z2Y3 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Homer1Q9Z2Y3 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Homer1Q9Z2Y3 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Homer1Q9Z2Y3 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Homer1Q9Z2Y3 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Homer1Q9Z2Y3 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Homer1Q9Z2Y3 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Homer1Q9Z2Y3 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Homer1Q9Z2Y3 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Homer1Q9Z2Y3 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Homer1Q9Z2Y3 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Homer1Q9Z2Y3 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Homer1Q9Z2Y3 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Homer1Q9Z2Y3 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Homer1Q9Z2Y3 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Homer1Q9Z2Y3 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Homer1Q9Z2Y3 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Homer1Q9Z2Y3 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Homer1Q9Z2Y3 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Homer1Q9Z2Y3 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Homer1Q9Z2Y3 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Homer1Q9Z2Y3 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Homer1Q9Z2Y3 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Homer1Q9Z2Y3 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Homer1Q9Z2Y3 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Homer1Q9Z2Y3 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Homer1Q9Z2Y3 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Homer1Q9Z2Y3 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Homer1Q9Z2Y3 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Homer1Q9Z2Y3 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Homer1Q9Z2Y3 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Homer1Q9Z2Y3 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Homer1Q9Z2Y3 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Homer1Q9Z2Y3 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Homer1Q9Z2Y3 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Homer1Q9Z2Y3 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Homer1Q9Z2Y3 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Homer1Q9Z2Y3 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Homer1Q9Z2Y3 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Homer1Q9Z2Y3 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Homer1Q9Z2Y3 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Homer1Q9Z2Y3 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Homer1Q9Z2Y3 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Homer1Q9Z2Y3 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Homer1Q9Z2Y3 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Homer1Q9Z2Y3 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Homer1Q9Z2Y3 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Homer1Q9Z2Y3 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Homer1Q9Z2Y3 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Homer1Q9Z2Y3 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Homer1Q9Z2Y3 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Homer1Q9Z2Y3 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Homer1Q9Z2Y3 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Homer1Q9Z2Y3 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Homer1Q9Z2Y3 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Homer1Q9Z2Y3 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Homer1Q9Z2Y3 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Homer1Q9Z2Y3 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Homer1Q9Z2Y3 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Homer1Q9Z2Y3 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Homer1Q9Z2Y3 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Homer1Q9Z2Y3 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Homer1Q9Z2Y3 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Homer1Q9Z2Y3 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Homer1Q9Z2Y3 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Homer1Q9Z2Y3 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Homer1Q9Z2Y3 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Homer1Q9Z2Y3 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms