Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z273

Tulp1, Tubby-related protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 543 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tulp1Q9Z273 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tulp1Q9Z273 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tulp1Q9Z273 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tulp1Q9Z273 mt-Rnr1-201ENSMUST00000082388 955 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Tulp1Q9Z273 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tulp1Q9Z273 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tulp1Q9Z273 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tulp1Q9Z273 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tulp1Q9Z273 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tulp1Q9Z273 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tulp1Q9Z273 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tulp1Q9Z273 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tulp1Q9Z273 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tulp1Q9Z273 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tulp1Q9Z273 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tulp1Q9Z273 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tulp1Q9Z273 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tulp1Q9Z273 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tulp1Q9Z273 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Tulp1Q9Z273 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tulp1Q9Z273 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tulp1Q9Z273 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tulp1Q9Z273 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tulp1Q9Z273 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tulp1Q9Z273 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tulp1Q9Z273 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tulp1Q9Z273 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Tulp1Q9Z273 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Tulp1Q9Z273 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Tulp1Q9Z273 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Tulp1Q9Z273 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
Tulp1Q9Z273 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tulp1Q9Z273 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tulp1Q9Z273 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tulp1Q9Z273 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tulp1Q9Z273 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tulp1Q9Z273 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tulp1Q9Z273 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Tulp1Q9Z273 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tulp1Q9Z273 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tulp1Q9Z273 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tulp1Q9Z273 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tulp1Q9Z273 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tulp1Q9Z273 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tulp1Q9Z273 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tulp1Q9Z273 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tulp1Q9Z273 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tulp1Q9Z273 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tulp1Q9Z273 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tulp1Q9Z273 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tulp1Q9Z273 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tulp1Q9Z273 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tulp1Q9Z273 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tulp1Q9Z273 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tulp1Q9Z273 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Tulp1Q9Z273 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tulp1Q9Z273 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tulp1Q9Z273 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tulp1Q9Z273 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tulp1Q9Z273 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tulp1Q9Z273 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tulp1Q9Z273 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tulp1Q9Z273 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tulp1Q9Z273 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tulp1Q9Z273 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tulp1Q9Z273 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tulp1Q9Z273 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tulp1Q9Z273 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tulp1Q9Z273 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tulp1Q9Z273 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tulp1Q9Z273 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tulp1Q9Z273 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tulp1Q9Z273 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tulp1Q9Z273 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tulp1Q9Z273 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tulp1Q9Z273 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tulp1Q9Z273 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tulp1Q9Z273 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tulp1Q9Z273 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tulp1Q9Z273 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Tulp1Q9Z273 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tulp1Q9Z273 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Tulp1Q9Z273 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tulp1Q9Z273 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tulp1Q9Z273 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tulp1Q9Z273 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tulp1Q9Z273 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tulp1Q9Z273 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tulp1Q9Z273 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tulp1Q9Z273 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tulp1Q9Z273 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tulp1Q9Z273 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tulp1Q9Z273 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tulp1Q9Z273 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tulp1Q9Z273 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tulp1Q9Z273 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tulp1Q9Z273 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tulp1Q9Z273 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tulp1Q9Z273 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tulp1Q9Z273 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms