Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z180

Setbp1, SET-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,582 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Setbp1Q9Z180 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Setbp1Q9Z180 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Setbp1Q9Z180 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Setbp1Q9Z180 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.29
Setbp1Q9Z180 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
Setbp1Q9Z180 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC29.39■■■□□ 2.29
Setbp1Q9Z180 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
Setbp1Q9Z180 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Setbp1Q9Z180 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
Setbp1Q9Z180 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Setbp1Q9Z180 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Setbp1Q9Z180 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Setbp1Q9Z180 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Setbp1Q9Z180 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Setbp1Q9Z180 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Setbp1Q9Z180 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
Setbp1Q9Z180 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Setbp1Q9Z180 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Setbp1Q9Z180 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Setbp1Q9Z180 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
Setbp1Q9Z180 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Setbp1Q9Z180 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
Setbp1Q9Z180 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Setbp1Q9Z180 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
Setbp1Q9Z180 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Setbp1Q9Z180 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Setbp1Q9Z180 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Setbp1Q9Z180 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Setbp1Q9Z180 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Setbp1Q9Z180 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Setbp1Q9Z180 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Setbp1Q9Z180 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Setbp1Q9Z180 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Setbp1Q9Z180 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
Setbp1Q9Z180 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Setbp1Q9Z180 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Setbp1Q9Z180 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Setbp1Q9Z180 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Setbp1Q9Z180 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
Setbp1Q9Z180 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Setbp1Q9Z180 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
Setbp1Q9Z180 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Setbp1Q9Z180 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Setbp1Q9Z180 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
Setbp1Q9Z180 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Setbp1Q9Z180 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Setbp1Q9Z180 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Setbp1Q9Z180 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Setbp1Q9Z180 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
Setbp1Q9Z180 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
Setbp1Q9Z180 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Setbp1Q9Z180 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Setbp1Q9Z180 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Setbp1Q9Z180 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
Setbp1Q9Z180 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
Setbp1Q9Z180 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Setbp1Q9Z180 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Setbp1Q9Z180 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Setbp1Q9Z180 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
Setbp1Q9Z180 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Setbp1Q9Z180 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Setbp1Q9Z180 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
Setbp1Q9Z180 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
Setbp1Q9Z180 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Setbp1Q9Z180 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Setbp1Q9Z180 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
Setbp1Q9Z180 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Setbp1Q9Z180 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Setbp1Q9Z180 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
Setbp1Q9Z180 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC29.3■■■□□ 2.28
Setbp1Q9Z180 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Setbp1Q9Z180 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
Setbp1Q9Z180 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Setbp1Q9Z180 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Setbp1Q9Z180 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
Setbp1Q9Z180 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Setbp1Q9Z180 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Setbp1Q9Z180 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Setbp1Q9Z180 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Setbp1Q9Z180 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Setbp1Q9Z180 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Setbp1Q9Z180 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
Setbp1Q9Z180 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
Setbp1Q9Z180 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Setbp1Q9Z180 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Setbp1Q9Z180 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Setbp1Q9Z180 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Setbp1Q9Z180 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Setbp1Q9Z180 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Setbp1Q9Z180 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
Setbp1Q9Z180 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
Setbp1Q9Z180 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Setbp1Q9Z180 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Setbp1Q9Z180 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Setbp1Q9Z180 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
Setbp1Q9Z180 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Setbp1Q9Z180 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Setbp1Q9Z180 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
Setbp1Q9Z180 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Setbp1Q9Z180 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms