Protein–RNA interactions for Protein: Q9WVL6

Extl3, Exostosin-like 3, mousemouse

Predictions only

Length 918 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Extl3Q9WVL6 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Extl3Q9WVL6 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Extl3Q9WVL6 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Extl3Q9WVL6 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Extl3Q9WVL6 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Extl3Q9WVL6 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Extl3Q9WVL6 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Extl3Q9WVL6 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Extl3Q9WVL6 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Extl3Q9WVL6 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Extl3Q9WVL6 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Extl3Q9WVL6 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Extl3Q9WVL6 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Extl3Q9WVL6 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Extl3Q9WVL6 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Extl3Q9WVL6 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Extl3Q9WVL6 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Extl3Q9WVL6 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Extl3Q9WVL6 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Extl3Q9WVL6 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Extl3Q9WVL6 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Extl3Q9WVL6 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Extl3Q9WVL6 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Extl3Q9WVL6 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Extl3Q9WVL6 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC21■□□□□ 0.95
Extl3Q9WVL6 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Extl3Q9WVL6 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Extl3Q9WVL6 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Extl3Q9WVL6 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
Extl3Q9WVL6 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
Extl3Q9WVL6 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
Extl3Q9WVL6 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Extl3Q9WVL6 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Extl3Q9WVL6 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Extl3Q9WVL6 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Extl3Q9WVL6 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Extl3Q9WVL6 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Extl3Q9WVL6 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Extl3Q9WVL6 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Extl3Q9WVL6 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Extl3Q9WVL6 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Extl3Q9WVL6 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Extl3Q9WVL6 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Extl3Q9WVL6 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Extl3Q9WVL6 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Extl3Q9WVL6 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Extl3Q9WVL6 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Extl3Q9WVL6 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Extl3Q9WVL6 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Extl3Q9WVL6 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Extl3Q9WVL6 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Extl3Q9WVL6 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Extl3Q9WVL6 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Extl3Q9WVL6 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
Extl3Q9WVL6 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Extl3Q9WVL6 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
Extl3Q9WVL6 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Extl3Q9WVL6 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Extl3Q9WVL6 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Extl3Q9WVL6 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Extl3Q9WVL6 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Extl3Q9WVL6 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Extl3Q9WVL6 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Extl3Q9WVL6 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Extl3Q9WVL6 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Extl3Q9WVL6 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Extl3Q9WVL6 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Extl3Q9WVL6 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Extl3Q9WVL6 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Extl3Q9WVL6 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Extl3Q9WVL6 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Extl3Q9WVL6 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Extl3Q9WVL6 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
Extl3Q9WVL6 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Extl3Q9WVL6 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Extl3Q9WVL6 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Extl3Q9WVL6 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Extl3Q9WVL6 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Extl3Q9WVL6 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Extl3Q9WVL6 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Extl3Q9WVL6 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Extl3Q9WVL6 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Extl3Q9WVL6 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Extl3Q9WVL6 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Extl3Q9WVL6 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Extl3Q9WVL6 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Extl3Q9WVL6 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Extl3Q9WVL6 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Extl3Q9WVL6 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
Extl3Q9WVL6 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Extl3Q9WVL6 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Extl3Q9WVL6 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Extl3Q9WVL6 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Extl3Q9WVL6 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Extl3Q9WVL6 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Extl3Q9WVL6 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Extl3Q9WVL6 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Extl3Q9WVL6 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Extl3Q9WVL6 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Extl3Q9WVL6 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.4 ms