Protein–RNA interactions for Protein: Q9WV18

Gabbr1, Gamma-aminobutyric acid type B receptor subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 960 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabbr1Q9WV18 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gabbr1Q9WV18 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gabbr1Q9WV18 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gabbr1Q9WV18 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gabbr1Q9WV18 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gabbr1Q9WV18 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gabbr1Q9WV18 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gabbr1Q9WV18 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gabbr1Q9WV18 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gabbr1Q9WV18 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gabbr1Q9WV18 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gabbr1Q9WV18 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gabbr1Q9WV18 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gabbr1Q9WV18 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gabbr1Q9WV18 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gabbr1Q9WV18 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gabbr1Q9WV18 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gabbr1Q9WV18 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gabbr1Q9WV18 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gabbr1Q9WV18 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gabbr1Q9WV18 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gabbr1Q9WV18 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gabbr1Q9WV18 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gabbr1Q9WV18 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gabbr1Q9WV18 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gabbr1Q9WV18 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gabbr1Q9WV18 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gabbr1Q9WV18 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gabbr1Q9WV18 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Gabbr1Q9WV18 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gabbr1Q9WV18 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gabbr1Q9WV18 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gabbr1Q9WV18 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gabbr1Q9WV18 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Gabbr1Q9WV18 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gabbr1Q9WV18 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gabbr1Q9WV18 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gabbr1Q9WV18 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gabbr1Q9WV18 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gabbr1Q9WV18 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gabbr1Q9WV18 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gabbr1Q9WV18 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gabbr1Q9WV18 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gabbr1Q9WV18 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gabbr1Q9WV18 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gabbr1Q9WV18 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gabbr1Q9WV18 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gabbr1Q9WV18 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Gabbr1Q9WV18 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gabbr1Q9WV18 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gabbr1Q9WV18 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gabbr1Q9WV18 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gabbr1Q9WV18 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gabbr1Q9WV18 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gabbr1Q9WV18 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gabbr1Q9WV18 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gabbr1Q9WV18 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gabbr1Q9WV18 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gabbr1Q9WV18 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gabbr1Q9WV18 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Gabbr1Q9WV18 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gabbr1Q9WV18 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gabbr1Q9WV18 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gabbr1Q9WV18 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gabbr1Q9WV18 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gabbr1Q9WV18 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gabbr1Q9WV18 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gabbr1Q9WV18 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gabbr1Q9WV18 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gabbr1Q9WV18 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gabbr1Q9WV18 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gabbr1Q9WV18 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gabbr1Q9WV18 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gabbr1Q9WV18 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gabbr1Q9WV18 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gabbr1Q9WV18 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gabbr1Q9WV18 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gabbr1Q9WV18 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gabbr1Q9WV18 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gabbr1Q9WV18 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gabbr1Q9WV18 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gabbr1Q9WV18 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gabbr1Q9WV18 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gabbr1Q9WV18 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gabbr1Q9WV18 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Gabbr1Q9WV18 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Gabbr1Q9WV18 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gabbr1Q9WV18 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Gabbr1Q9WV18 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gabbr1Q9WV18 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gabbr1Q9WV18 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gabbr1Q9WV18 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gabbr1Q9WV18 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gabbr1Q9WV18 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gabbr1Q9WV18 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gabbr1Q9WV18 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gabbr1Q9WV18 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gabbr1Q9WV18 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gabbr1Q9WV18 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gabbr1Q9WV18 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.7 ms