Protein–RNA interactions for Protein: Q9WUK7

Opn3, Opsin-3, mousemouse

Predictions only

Length 400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Opn3Q9WUK7 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Opn3Q9WUK7 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Opn3Q9WUK7 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Opn3Q9WUK7 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Opn3Q9WUK7 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Opn3Q9WUK7 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Opn3Q9WUK7 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Opn3Q9WUK7 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Opn3Q9WUK7 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Opn3Q9WUK7 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Opn3Q9WUK7 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Opn3Q9WUK7 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Opn3Q9WUK7 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Opn3Q9WUK7 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Opn3Q9WUK7 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Opn3Q9WUK7 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Opn3Q9WUK7 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Opn3Q9WUK7 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Opn3Q9WUK7 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Opn3Q9WUK7 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Opn3Q9WUK7 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Opn3Q9WUK7 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Opn3Q9WUK7 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Opn3Q9WUK7 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Opn3Q9WUK7 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Opn3Q9WUK7 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Opn3Q9WUK7 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Opn3Q9WUK7 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Opn3Q9WUK7 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Opn3Q9WUK7 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Opn3Q9WUK7 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Opn3Q9WUK7 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Opn3Q9WUK7 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Opn3Q9WUK7 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Opn3Q9WUK7 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Opn3Q9WUK7 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Opn3Q9WUK7 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Opn3Q9WUK7 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Opn3Q9WUK7 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Opn3Q9WUK7 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Opn3Q9WUK7 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Opn3Q9WUK7 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Opn3Q9WUK7 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Opn3Q9WUK7 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Opn3Q9WUK7 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Opn3Q9WUK7 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Opn3Q9WUK7 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Opn3Q9WUK7 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Opn3Q9WUK7 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Opn3Q9WUK7 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Opn3Q9WUK7 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Opn3Q9WUK7 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Opn3Q9WUK7 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Opn3Q9WUK7 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Opn3Q9WUK7 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Opn3Q9WUK7 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Opn3Q9WUK7 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Opn3Q9WUK7 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Opn3Q9WUK7 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Opn3Q9WUK7 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Opn3Q9WUK7 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Opn3Q9WUK7 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Opn3Q9WUK7 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Opn3Q9WUK7 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Opn3Q9WUK7 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Opn3Q9WUK7 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Opn3Q9WUK7 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Opn3Q9WUK7 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Opn3Q9WUK7 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Opn3Q9WUK7 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Opn3Q9WUK7 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Opn3Q9WUK7 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Opn3Q9WUK7 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Opn3Q9WUK7 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Opn3Q9WUK7 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Opn3Q9WUK7 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Opn3Q9WUK7 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Opn3Q9WUK7 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Opn3Q9WUK7 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Opn3Q9WUK7 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Opn3Q9WUK7 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Opn3Q9WUK7 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Opn3Q9WUK7 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Opn3Q9WUK7 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Opn3Q9WUK7 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Opn3Q9WUK7 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Opn3Q9WUK7 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Opn3Q9WUK7 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Opn3Q9WUK7 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Opn3Q9WUK7 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Opn3Q9WUK7 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Opn3Q9WUK7 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Opn3Q9WUK7 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Opn3Q9WUK7 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Opn3Q9WUK7 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Opn3Q9WUK7 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Opn3Q9WUK7 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Opn3Q9WUK7 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Opn3Q9WUK7 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Opn3Q9WUK7 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms