Protein–RNA interactions for Protein: Q9R014

Ctsj, Cathepsin J, mousemouse

Predictions only

Length 334 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtsjQ9R014 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CtsjQ9R014 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CtsjQ9R014 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CtsjQ9R014 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
CtsjQ9R014 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
CtsjQ9R014 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CtsjQ9R014 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CtsjQ9R014 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
CtsjQ9R014 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CtsjQ9R014 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CtsjQ9R014 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CtsjQ9R014 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CtsjQ9R014 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CtsjQ9R014 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CtsjQ9R014 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CtsjQ9R014 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CtsjQ9R014 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CtsjQ9R014 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CtsjQ9R014 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CtsjQ9R014 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CtsjQ9R014 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CtsjQ9R014 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CtsjQ9R014 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CtsjQ9R014 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CtsjQ9R014 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CtsjQ9R014 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
CtsjQ9R014 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CtsjQ9R014 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CtsjQ9R014 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CtsjQ9R014 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CtsjQ9R014 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CtsjQ9R014 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CtsjQ9R014 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CtsjQ9R014 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
CtsjQ9R014 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CtsjQ9R014 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CtsjQ9R014 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CtsjQ9R014 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CtsjQ9R014 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CtsjQ9R014 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CtsjQ9R014 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CtsjQ9R014 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CtsjQ9R014 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CtsjQ9R014 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
CtsjQ9R014 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
CtsjQ9R014 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CtsjQ9R014 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CtsjQ9R014 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CtsjQ9R014 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CtsjQ9R014 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
CtsjQ9R014 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CtsjQ9R014 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
CtsjQ9R014 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CtsjQ9R014 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CtsjQ9R014 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CtsjQ9R014 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CtsjQ9R014 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CtsjQ9R014 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CtsjQ9R014 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CtsjQ9R014 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CtsjQ9R014 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CtsjQ9R014 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CtsjQ9R014 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CtsjQ9R014 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CtsjQ9R014 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CtsjQ9R014 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CtsjQ9R014 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CtsjQ9R014 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CtsjQ9R014 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CtsjQ9R014 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CtsjQ9R014 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CtsjQ9R014 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CtsjQ9R014 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CtsjQ9R014 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CtsjQ9R014 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CtsjQ9R014 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CtsjQ9R014 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CtsjQ9R014 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CtsjQ9R014 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CtsjQ9R014 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CtsjQ9R014 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CtsjQ9R014 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CtsjQ9R014 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CtsjQ9R014 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CtsjQ9R014 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CtsjQ9R014 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CtsjQ9R014 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CtsjQ9R014 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CtsjQ9R014 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CtsjQ9R014 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CtsjQ9R014 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CtsjQ9R014 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CtsjQ9R014 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CtsjQ9R014 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CtsjQ9R014 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CtsjQ9R014 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
CtsjQ9R014 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CtsjQ9R014 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CtsjQ9R014 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CtsjQ9R014 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.8 ms