Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZS0

Col4a3, Collagen alpha-3(IV) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,669 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col4a3Q9QZS0 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Col4a3Q9QZS0 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Col4a3Q9QZS0 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Col4a3Q9QZS0 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Col4a3Q9QZS0 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Col4a3Q9QZS0 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Col4a3Q9QZS0 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Col4a3Q9QZS0 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Col4a3Q9QZS0 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Col4a3Q9QZS0 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Col4a3Q9QZS0 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Col4a3Q9QZS0 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Col4a3Q9QZS0 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Col4a3Q9QZS0 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Col4a3Q9QZS0 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Col4a3Q9QZS0 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Col4a3Q9QZS0 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Col4a3Q9QZS0 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Col4a3Q9QZS0 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Col4a3Q9QZS0 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Col4a3Q9QZS0 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Col4a3Q9QZS0 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Col4a3Q9QZS0 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Col4a3Q9QZS0 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Col4a3Q9QZS0 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Col4a3Q9QZS0 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Col4a3Q9QZS0 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Col4a3Q9QZS0 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Col4a3Q9QZS0 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
Col4a3Q9QZS0 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Col4a3Q9QZS0 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Col4a3Q9QZS0 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Col4a3Q9QZS0 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Col4a3Q9QZS0 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
Col4a3Q9QZS0 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Col4a3Q9QZS0 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Col4a3Q9QZS0 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Col4a3Q9QZS0 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Col4a3Q9QZS0 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Col4a3Q9QZS0 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
Col4a3Q9QZS0 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Col4a3Q9QZS0 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Col4a3Q9QZS0 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Col4a3Q9QZS0 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Col4a3Q9QZS0 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Col4a3Q9QZS0 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Col4a3Q9QZS0 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Col4a3Q9QZS0 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Col4a3Q9QZS0 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Col4a3Q9QZS0 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Col4a3Q9QZS0 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Col4a3Q9QZS0 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
Col4a3Q9QZS0 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
Col4a3Q9QZS0 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Col4a3Q9QZS0 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Col4a3Q9QZS0 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Col4a3Q9QZS0 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Col4a3Q9QZS0 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Col4a3Q9QZS0 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
Col4a3Q9QZS0 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Col4a3Q9QZS0 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Col4a3Q9QZS0 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Col4a3Q9QZS0 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Col4a3Q9QZS0 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Col4a3Q9QZS0 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC20.77■□□□□ 0.91
Col4a3Q9QZS0 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Col4a3Q9QZS0 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC20.77■□□□□ 0.91
Col4a3Q9QZS0 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Col4a3Q9QZS0 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Col4a3Q9QZS0 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Col4a3Q9QZS0 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Col4a3Q9QZS0 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Col4a3Q9QZS0 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Col4a3Q9QZS0 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Col4a3Q9QZS0 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Col4a3Q9QZS0 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Col4a3Q9QZS0 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Col4a3Q9QZS0 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Col4a3Q9QZS0 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Col4a3Q9QZS0 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Col4a3Q9QZS0 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Col4a3Q9QZS0 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Col4a3Q9QZS0 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Col4a3Q9QZS0 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Col4a3Q9QZS0 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
Col4a3Q9QZS0 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Col4a3Q9QZS0 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Col4a3Q9QZS0 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Col4a3Q9QZS0 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Col4a3Q9QZS0 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Col4a3Q9QZS0 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Col4a3Q9QZS0 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Col4a3Q9QZS0 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Col4a3Q9QZS0 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
Col4a3Q9QZS0 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Col4a3Q9QZS0 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Col4a3Q9QZS0 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Col4a3Q9QZS0 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Col4a3Q9QZS0 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
Col4a3Q9QZS0 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms