Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZQ0

Npas3, Neuronal PAS domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 925 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Npas3Q9QZQ0 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Npas3Q9QZQ0 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Npas3Q9QZQ0 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Npas3Q9QZQ0 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Npas3Q9QZQ0 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Npas3Q9QZQ0 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Npas3Q9QZQ0 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Npas3Q9QZQ0 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Npas3Q9QZQ0 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Npas3Q9QZQ0 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Npas3Q9QZQ0 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Npas3Q9QZQ0 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Npas3Q9QZQ0 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Npas3Q9QZQ0 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Npas3Q9QZQ0 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Npas3Q9QZQ0 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Npas3Q9QZQ0 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Npas3Q9QZQ0 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Npas3Q9QZQ0 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Npas3Q9QZQ0 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Npas3Q9QZQ0 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Npas3Q9QZQ0 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Npas3Q9QZQ0 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Npas3Q9QZQ0 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Npas3Q9QZQ0 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Npas3Q9QZQ0 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Npas3Q9QZQ0 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Npas3Q9QZQ0 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Npas3Q9QZQ0 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Npas3Q9QZQ0 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Npas3Q9QZQ0 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Npas3Q9QZQ0 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Npas3Q9QZQ0 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Npas3Q9QZQ0 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Npas3Q9QZQ0 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Npas3Q9QZQ0 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Npas3Q9QZQ0 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Npas3Q9QZQ0 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Npas3Q9QZQ0 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Npas3Q9QZQ0 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Npas3Q9QZQ0 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Npas3Q9QZQ0 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Npas3Q9QZQ0 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Npas3Q9QZQ0 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Npas3Q9QZQ0 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Npas3Q9QZQ0 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Npas3Q9QZQ0 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Npas3Q9QZQ0 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Npas3Q9QZQ0 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Npas3Q9QZQ0 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Npas3Q9QZQ0 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Npas3Q9QZQ0 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Npas3Q9QZQ0 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Npas3Q9QZQ0 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Npas3Q9QZQ0 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Npas3Q9QZQ0 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Npas3Q9QZQ0 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Npas3Q9QZQ0 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Npas3Q9QZQ0 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Npas3Q9QZQ0 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Npas3Q9QZQ0 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Npas3Q9QZQ0 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Npas3Q9QZQ0 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Npas3Q9QZQ0 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Npas3Q9QZQ0 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Npas3Q9QZQ0 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Npas3Q9QZQ0 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Npas3Q9QZQ0 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Npas3Q9QZQ0 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Npas3Q9QZQ0 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Npas3Q9QZQ0 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Npas3Q9QZQ0 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Npas3Q9QZQ0 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Npas3Q9QZQ0 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Npas3Q9QZQ0 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Npas3Q9QZQ0 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Npas3Q9QZQ0 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Npas3Q9QZQ0 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Npas3Q9QZQ0 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Npas3Q9QZQ0 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Npas3Q9QZQ0 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Npas3Q9QZQ0 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Npas3Q9QZQ0 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Npas3Q9QZQ0 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Npas3Q9QZQ0 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Npas3Q9QZQ0 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Npas3Q9QZQ0 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Npas3Q9QZQ0 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Npas3Q9QZQ0 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Npas3Q9QZQ0 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Npas3Q9QZQ0 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Npas3Q9QZQ0 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Npas3Q9QZQ0 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Npas3Q9QZQ0 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Npas3Q9QZQ0 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Npas3Q9QZQ0 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Npas3Q9QZQ0 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Npas3Q9QZQ0 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Npas3Q9QZQ0 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Npas3Q9QZQ0 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms