Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZB6

Nr4a3, Nuclear receptor subfamily 4 group A member 3, mousemouse

Predictions only

Length 627 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nr4a3Q9QZB6 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Nr4a3Q9QZB6 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Nr4a3Q9QZB6 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Nr4a3Q9QZB6 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Nr4a3Q9QZB6 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Nr4a3Q9QZB6 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Nr4a3Q9QZB6 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Nr4a3Q9QZB6 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Nr4a3Q9QZB6 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Nr4a3Q9QZB6 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Nr4a3Q9QZB6 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Nr4a3Q9QZB6 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Nr4a3Q9QZB6 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Nr4a3Q9QZB6 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Nr4a3Q9QZB6 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Nr4a3Q9QZB6 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Nr4a3Q9QZB6 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Nr4a3Q9QZB6 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Nr4a3Q9QZB6 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Nr4a3Q9QZB6 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Nr4a3Q9QZB6 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Nr4a3Q9QZB6 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Nr4a3Q9QZB6 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Nr4a3Q9QZB6 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Nr4a3Q9QZB6 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Nr4a3Q9QZB6 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Nr4a3Q9QZB6 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Nr4a3Q9QZB6 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Nr4a3Q9QZB6 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Nr4a3Q9QZB6 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Nr4a3Q9QZB6 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Nr4a3Q9QZB6 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Nr4a3Q9QZB6 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Nr4a3Q9QZB6 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Nr4a3Q9QZB6 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Nr4a3Q9QZB6 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Nr4a3Q9QZB6 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Nr4a3Q9QZB6 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Nr4a3Q9QZB6 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Nr4a3Q9QZB6 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Nr4a3Q9QZB6 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Nr4a3Q9QZB6 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Nr4a3Q9QZB6 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Nr4a3Q9QZB6 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Nr4a3Q9QZB6 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Nr4a3Q9QZB6 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Nr4a3Q9QZB6 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Nr4a3Q9QZB6 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Nr4a3Q9QZB6 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Nr4a3Q9QZB6 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Nr4a3Q9QZB6 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Nr4a3Q9QZB6 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Nr4a3Q9QZB6 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Nr4a3Q9QZB6 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Nr4a3Q9QZB6 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Nr4a3Q9QZB6 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Nr4a3Q9QZB6 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Nr4a3Q9QZB6 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Nr4a3Q9QZB6 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Nr4a3Q9QZB6 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Nr4a3Q9QZB6 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Nr4a3Q9QZB6 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Nr4a3Q9QZB6 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Nr4a3Q9QZB6 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Nr4a3Q9QZB6 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Nr4a3Q9QZB6 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Nr4a3Q9QZB6 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Nr4a3Q9QZB6 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Nr4a3Q9QZB6 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Nr4a3Q9QZB6 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Nr4a3Q9QZB6 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Nr4a3Q9QZB6 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Nr4a3Q9QZB6 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Nr4a3Q9QZB6 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Nr4a3Q9QZB6 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Nr4a3Q9QZB6 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Nr4a3Q9QZB6 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Nr4a3Q9QZB6 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Nr4a3Q9QZB6 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Nr4a3Q9QZB6 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Nr4a3Q9QZB6 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Nr4a3Q9QZB6 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Nr4a3Q9QZB6 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Nr4a3Q9QZB6 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
Nr4a3Q9QZB6 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Nr4a3Q9QZB6 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
Nr4a3Q9QZB6 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Nr4a3Q9QZB6 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Nr4a3Q9QZB6 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Nr4a3Q9QZB6 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Nr4a3Q9QZB6 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
Nr4a3Q9QZB6 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Nr4a3Q9QZB6 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
Nr4a3Q9QZB6 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Nr4a3Q9QZB6 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Nr4a3Q9QZB6 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Nr4a3Q9QZB6 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Nr4a3Q9QZB6 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Nr4a3Q9QZB6 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Nr4a3Q9QZB6 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms