Protein–RNA interactions for Protein: Q9QYR6

Map1a, Microtubule-associated protein 1A, mousemouse

Predictions only

Length 2,776 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Map1aQ9QYR6 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Map1aQ9QYR6 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Map1aQ9QYR6 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Map1aQ9QYR6 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Map1aQ9QYR6 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Map1aQ9QYR6 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Map1aQ9QYR6 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Map1aQ9QYR6 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Map1aQ9QYR6 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Map1aQ9QYR6 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Map1aQ9QYR6 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Map1aQ9QYR6 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Map1aQ9QYR6 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Map1aQ9QYR6 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Map1aQ9QYR6 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Map1aQ9QYR6 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Map1aQ9QYR6 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Map1aQ9QYR6 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Map1aQ9QYR6 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Map1aQ9QYR6 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Map1aQ9QYR6 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Map1aQ9QYR6 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Map1aQ9QYR6 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Map1aQ9QYR6 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Map1aQ9QYR6 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Map1aQ9QYR6 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Map1aQ9QYR6 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Map1aQ9QYR6 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Map1aQ9QYR6 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Map1aQ9QYR6 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Map1aQ9QYR6 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Map1aQ9QYR6 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Map1aQ9QYR6 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Map1aQ9QYR6 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Map1aQ9QYR6 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Map1aQ9QYR6 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Map1aQ9QYR6 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Map1aQ9QYR6 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Map1aQ9QYR6 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Map1aQ9QYR6 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Map1aQ9QYR6 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Map1aQ9QYR6 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Map1aQ9QYR6 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Map1aQ9QYR6 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Map1aQ9QYR6 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Map1aQ9QYR6 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Map1aQ9QYR6 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Map1aQ9QYR6 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Map1aQ9QYR6 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Map1aQ9QYR6 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Map1aQ9QYR6 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Map1aQ9QYR6 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Map1aQ9QYR6 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Map1aQ9QYR6 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Map1aQ9QYR6 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Map1aQ9QYR6 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Map1aQ9QYR6 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Map1aQ9QYR6 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Map1aQ9QYR6 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Map1aQ9QYR6 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Map1aQ9QYR6 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Map1aQ9QYR6 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Map1aQ9QYR6 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Map1aQ9QYR6 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Map1aQ9QYR6 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Map1aQ9QYR6 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Map1aQ9QYR6 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Map1aQ9QYR6 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Map1aQ9QYR6 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Map1aQ9QYR6 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Map1aQ9QYR6 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Map1aQ9QYR6 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Map1aQ9QYR6 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Map1aQ9QYR6 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Map1aQ9QYR6 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Map1aQ9QYR6 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Map1aQ9QYR6 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Map1aQ9QYR6 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Map1aQ9QYR6 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Map1aQ9QYR6 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Map1aQ9QYR6 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Map1aQ9QYR6 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Map1aQ9QYR6 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Map1aQ9QYR6 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Map1aQ9QYR6 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Map1aQ9QYR6 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Map1aQ9QYR6 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Map1aQ9QYR6 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Map1aQ9QYR6 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Map1aQ9QYR6 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Map1aQ9QYR6 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Map1aQ9QYR6 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Map1aQ9QYR6 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Map1aQ9QYR6 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Map1aQ9QYR6 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Map1aQ9QYR6 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Map1aQ9QYR6 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Map1aQ9QYR6 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Map1aQ9QYR6 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Map1aQ9QYR6 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.2 ms