Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXV1

Cbx8, Chromobox protein homolog 8, mousemouse

Predictions only

Length 362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cbx8Q9QXV1 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cbx8Q9QXV1 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cbx8Q9QXV1 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cbx8Q9QXV1 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cbx8Q9QXV1 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cbx8Q9QXV1 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cbx8Q9QXV1 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cbx8Q9QXV1 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cbx8Q9QXV1 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cbx8Q9QXV1 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cbx8Q9QXV1 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cbx8Q9QXV1 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cbx8Q9QXV1 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cbx8Q9QXV1 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cbx8Q9QXV1 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cbx8Q9QXV1 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cbx8Q9QXV1 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cbx8Q9QXV1 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cbx8Q9QXV1 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cbx8Q9QXV1 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cbx8Q9QXV1 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Cbx8Q9QXV1 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cbx8Q9QXV1 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cbx8Q9QXV1 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cbx8Q9QXV1 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cbx8Q9QXV1 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cbx8Q9QXV1 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cbx8Q9QXV1 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cbx8Q9QXV1 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cbx8Q9QXV1 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cbx8Q9QXV1 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cbx8Q9QXV1 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cbx8Q9QXV1 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cbx8Q9QXV1 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cbx8Q9QXV1 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Cbx8Q9QXV1 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cbx8Q9QXV1 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cbx8Q9QXV1 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cbx8Q9QXV1 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cbx8Q9QXV1 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cbx8Q9QXV1 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cbx8Q9QXV1 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cbx8Q9QXV1 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cbx8Q9QXV1 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cbx8Q9QXV1 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cbx8Q9QXV1 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cbx8Q9QXV1 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cbx8Q9QXV1 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cbx8Q9QXV1 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cbx8Q9QXV1 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cbx8Q9QXV1 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cbx8Q9QXV1 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cbx8Q9QXV1 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cbx8Q9QXV1 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cbx8Q9QXV1 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cbx8Q9QXV1 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cbx8Q9QXV1 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Cbx8Q9QXV1 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Cbx8Q9QXV1 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cbx8Q9QXV1 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cbx8Q9QXV1 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cbx8Q9QXV1 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cbx8Q9QXV1 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Cbx8Q9QXV1 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Cbx8Q9QXV1 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cbx8Q9QXV1 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cbx8Q9QXV1 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Cbx8Q9QXV1 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cbx8Q9QXV1 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cbx8Q9QXV1 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cbx8Q9QXV1 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cbx8Q9QXV1 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cbx8Q9QXV1 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cbx8Q9QXV1 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cbx8Q9QXV1 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cbx8Q9QXV1 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cbx8Q9QXV1 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cbx8Q9QXV1 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cbx8Q9QXV1 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Cbx8Q9QXV1 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cbx8Q9QXV1 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cbx8Q9QXV1 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cbx8Q9QXV1 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cbx8Q9QXV1 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cbx8Q9QXV1 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cbx8Q9QXV1 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cbx8Q9QXV1 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cbx8Q9QXV1 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cbx8Q9QXV1 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cbx8Q9QXV1 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cbx8Q9QXV1 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cbx8Q9QXV1 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cbx8Q9QXV1 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cbx8Q9QXV1 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cbx8Q9QXV1 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cbx8Q9QXV1 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cbx8Q9QXV1 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cbx8Q9QXV1 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cbx8Q9QXV1 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cbx8Q9QXV1 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms