Protein–RNA interactions for Protein: Q9QX29

Trpc5, Short transient receptor potential channel 5, mousemouse

Predictions only

Length 975 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpc5Q9QX29 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Trpc5Q9QX29 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Trpc5Q9QX29 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Trpc5Q9QX29 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Trpc5Q9QX29 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Trpc5Q9QX29 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Trpc5Q9QX29 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Trpc5Q9QX29 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Trpc5Q9QX29 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Trpc5Q9QX29 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Trpc5Q9QX29 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Trpc5Q9QX29 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Trpc5Q9QX29 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Trpc5Q9QX29 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Trpc5Q9QX29 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Trpc5Q9QX29 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Trpc5Q9QX29 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Trpc5Q9QX29 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Trpc5Q9QX29 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Trpc5Q9QX29 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Trpc5Q9QX29 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Trpc5Q9QX29 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Trpc5Q9QX29 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Trpc5Q9QX29 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Trpc5Q9QX29 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Trpc5Q9QX29 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Trpc5Q9QX29 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Trpc5Q9QX29 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Trpc5Q9QX29 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Trpc5Q9QX29 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Trpc5Q9QX29 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Trpc5Q9QX29 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Trpc5Q9QX29 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Trpc5Q9QX29 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Trpc5Q9QX29 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Trpc5Q9QX29 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Trpc5Q9QX29 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Trpc5Q9QX29 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Trpc5Q9QX29 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Trpc5Q9QX29 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Trpc5Q9QX29 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Trpc5Q9QX29 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Trpc5Q9QX29 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Trpc5Q9QX29 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Trpc5Q9QX29 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Trpc5Q9QX29 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Trpc5Q9QX29 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Trpc5Q9QX29 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Trpc5Q9QX29 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Trpc5Q9QX29 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Trpc5Q9QX29 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Trpc5Q9QX29 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Trpc5Q9QX29 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Trpc5Q9QX29 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Trpc5Q9QX29 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Trpc5Q9QX29 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Trpc5Q9QX29 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Trpc5Q9QX29 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Trpc5Q9QX29 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Trpc5Q9QX29 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Trpc5Q9QX29 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Trpc5Q9QX29 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Trpc5Q9QX29 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Trpc5Q9QX29 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Trpc5Q9QX29 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Trpc5Q9QX29 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Trpc5Q9QX29 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Trpc5Q9QX29 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Trpc5Q9QX29 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Trpc5Q9QX29 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Trpc5Q9QX29 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Trpc5Q9QX29 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Trpc5Q9QX29 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Trpc5Q9QX29 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Trpc5Q9QX29 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Trpc5Q9QX29 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Trpc5Q9QX29 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Trpc5Q9QX29 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Trpc5Q9QX29 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Trpc5Q9QX29 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Trpc5Q9QX29 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Trpc5Q9QX29 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Trpc5Q9QX29 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Trpc5Q9QX29 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Trpc5Q9QX29 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Trpc5Q9QX29 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Trpc5Q9QX29 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Trpc5Q9QX29 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Trpc5Q9QX29 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Trpc5Q9QX29 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Trpc5Q9QX29 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Trpc5Q9QX29 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Trpc5Q9QX29 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Trpc5Q9QX29 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Trpc5Q9QX29 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Trpc5Q9QX29 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Trpc5Q9QX29 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Trpc5Q9QX29 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Trpc5Q9QX29 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Trpc5Q9QX29 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms