Protein–RNA interactions for Protein: Q9QWW1

Homer2, Homer protein homolog 2, mousemouse

Predictions only

Length 354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Homer2Q9QWW1 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Homer2Q9QWW1 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Homer2Q9QWW1 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Homer2Q9QWW1 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Homer2Q9QWW1 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Homer2Q9QWW1 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Homer2Q9QWW1 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Homer2Q9QWW1 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Homer2Q9QWW1 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Homer2Q9QWW1 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Homer2Q9QWW1 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Homer2Q9QWW1 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Homer2Q9QWW1 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Homer2Q9QWW1 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Homer2Q9QWW1 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Homer2Q9QWW1 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Homer2Q9QWW1 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Homer2Q9QWW1 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Homer2Q9QWW1 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Homer2Q9QWW1 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Homer2Q9QWW1 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Homer2Q9QWW1 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Homer2Q9QWW1 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Homer2Q9QWW1 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Homer2Q9QWW1 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Homer2Q9QWW1 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Homer2Q9QWW1 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Homer2Q9QWW1 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Homer2Q9QWW1 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Homer2Q9QWW1 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Homer2Q9QWW1 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Homer2Q9QWW1 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Homer2Q9QWW1 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Homer2Q9QWW1 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Homer2Q9QWW1 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Homer2Q9QWW1 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Homer2Q9QWW1 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Homer2Q9QWW1 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Homer2Q9QWW1 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Homer2Q9QWW1 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Homer2Q9QWW1 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Homer2Q9QWW1 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Homer2Q9QWW1 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Homer2Q9QWW1 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Homer2Q9QWW1 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Homer2Q9QWW1 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Homer2Q9QWW1 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Homer2Q9QWW1 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Homer2Q9QWW1 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Homer2Q9QWW1 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Homer2Q9QWW1 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Homer2Q9QWW1 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Homer2Q9QWW1 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Homer2Q9QWW1 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Homer2Q9QWW1 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Homer2Q9QWW1 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Homer2Q9QWW1 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Homer2Q9QWW1 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Homer2Q9QWW1 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Homer2Q9QWW1 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Homer2Q9QWW1 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Homer2Q9QWW1 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Homer2Q9QWW1 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Homer2Q9QWW1 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Homer2Q9QWW1 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Homer2Q9QWW1 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Homer2Q9QWW1 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Homer2Q9QWW1 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Homer2Q9QWW1 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Homer2Q9QWW1 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Homer2Q9QWW1 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Homer2Q9QWW1 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Homer2Q9QWW1 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Homer2Q9QWW1 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Homer2Q9QWW1 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Homer2Q9QWW1 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Homer2Q9QWW1 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Homer2Q9QWW1 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Homer2Q9QWW1 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Homer2Q9QWW1 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Homer2Q9QWW1 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Homer2Q9QWW1 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Homer2Q9QWW1 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Homer2Q9QWW1 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Homer2Q9QWW1 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Homer2Q9QWW1 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Homer2Q9QWW1 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Homer2Q9QWW1 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Homer2Q9QWW1 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Homer2Q9QWW1 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Homer2Q9QWW1 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Homer2Q9QWW1 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Homer2Q9QWW1 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Homer2Q9QWW1 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Homer2Q9QWW1 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Homer2Q9QWW1 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Homer2Q9QWW1 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Homer2Q9QWW1 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Homer2Q9QWW1 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Homer2Q9QWW1 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms