Protein–RNA interactions for Protein: Q9JME9

Vstm2b, V-set and transmembrane domain-containing protein 2B, mousemouse

Predictions only

Length 285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vstm2bQ9JME9 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Vstm2bQ9JME9 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Vstm2bQ9JME9 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Vstm2bQ9JME9 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Vstm2bQ9JME9 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Vstm2bQ9JME9 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Vstm2bQ9JME9 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Vstm2bQ9JME9 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Vstm2bQ9JME9 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Vstm2bQ9JME9 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Vstm2bQ9JME9 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Vstm2bQ9JME9 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Vstm2bQ9JME9 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Vstm2bQ9JME9 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Vstm2bQ9JME9 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Vstm2bQ9JME9 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Vstm2bQ9JME9 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Vstm2bQ9JME9 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Vstm2bQ9JME9 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Vstm2bQ9JME9 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Vstm2bQ9JME9 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Vstm2bQ9JME9 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Vstm2bQ9JME9 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Vstm2bQ9JME9 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Vstm2bQ9JME9 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Vstm2bQ9JME9 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Vstm2bQ9JME9 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Vstm2bQ9JME9 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Vstm2bQ9JME9 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Vstm2bQ9JME9 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Vstm2bQ9JME9 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Vstm2bQ9JME9 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Vstm2bQ9JME9 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Vstm2bQ9JME9 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Vstm2bQ9JME9 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Vstm2bQ9JME9 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Vstm2bQ9JME9 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Vstm2bQ9JME9 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Vstm2bQ9JME9 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Vstm2bQ9JME9 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Vstm2bQ9JME9 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Vstm2bQ9JME9 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Vstm2bQ9JME9 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Vstm2bQ9JME9 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Vstm2bQ9JME9 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Vstm2bQ9JME9 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Vstm2bQ9JME9 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Vstm2bQ9JME9 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Vstm2bQ9JME9 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Vstm2bQ9JME9 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Vstm2bQ9JME9 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Vstm2bQ9JME9 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Vstm2bQ9JME9 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Vstm2bQ9JME9 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Vstm2bQ9JME9 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Vstm2bQ9JME9 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Vstm2bQ9JME9 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Vstm2bQ9JME9 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Vstm2bQ9JME9 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Vstm2bQ9JME9 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Vstm2bQ9JME9 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Vstm2bQ9JME9 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Vstm2bQ9JME9 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Vstm2bQ9JME9 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Vstm2bQ9JME9 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Vstm2bQ9JME9 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Vstm2bQ9JME9 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Vstm2bQ9JME9 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Vstm2bQ9JME9 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Vstm2bQ9JME9 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Vstm2bQ9JME9 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Vstm2bQ9JME9 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Vstm2bQ9JME9 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Vstm2bQ9JME9 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Vstm2bQ9JME9 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Vstm2bQ9JME9 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Vstm2bQ9JME9 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Vstm2bQ9JME9 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Vstm2bQ9JME9 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Vstm2bQ9JME9 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Vstm2bQ9JME9 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Vstm2bQ9JME9 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Vstm2bQ9JME9 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Vstm2bQ9JME9 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Vstm2bQ9JME9 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Vstm2bQ9JME9 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Vstm2bQ9JME9 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Vstm2bQ9JME9 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Vstm2bQ9JME9 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Vstm2bQ9JME9 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Vstm2bQ9JME9 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Vstm2bQ9JME9 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Vstm2bQ9JME9 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Vstm2bQ9JME9 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Vstm2bQ9JME9 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Vstm2bQ9JME9 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Vstm2bQ9JME9 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Vstm2bQ9JME9 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Vstm2bQ9JME9 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Vstm2bQ9JME9 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms