Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLK7

Cabp1, Calcium-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cabp1Q9JLK7 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Cabp1Q9JLK7 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Cabp1Q9JLK7 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Cabp1Q9JLK7 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Cabp1Q9JLK7 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Cabp1Q9JLK7 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
Cabp1Q9JLK7 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
Cabp1Q9JLK7 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
Cabp1Q9JLK7 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Cabp1Q9JLK7 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Cabp1Q9JLK7 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
Cabp1Q9JLK7 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Cabp1Q9JLK7 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Cabp1Q9JLK7 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Cabp1Q9JLK7 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Cabp1Q9JLK7 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Cabp1Q9JLK7 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Cabp1Q9JLK7 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Cabp1Q9JLK7 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
Cabp1Q9JLK7 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Cabp1Q9JLK7 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Cabp1Q9JLK7 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Cabp1Q9JLK7 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Cabp1Q9JLK7 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Cabp1Q9JLK7 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Cabp1Q9JLK7 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
Cabp1Q9JLK7 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.08
Cabp1Q9JLK7 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Cabp1Q9JLK7 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Cabp1Q9JLK7 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
Cabp1Q9JLK7 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Cabp1Q9JLK7 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Cabp1Q9JLK7 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Cabp1Q9JLK7 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Cabp1Q9JLK7 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Cabp1Q9JLK7 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Cabp1Q9JLK7 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Cabp1Q9JLK7 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Cabp1Q9JLK7 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Cabp1Q9JLK7 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Cabp1Q9JLK7 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Cabp1Q9JLK7 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Cabp1Q9JLK7 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Cabp1Q9JLK7 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Cabp1Q9JLK7 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Cabp1Q9JLK7 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Cabp1Q9JLK7 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Cabp1Q9JLK7 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Cabp1Q9JLK7 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Cabp1Q9JLK7 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Cabp1Q9JLK7 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Cabp1Q9JLK7 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Cabp1Q9JLK7 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Cabp1Q9JLK7 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Cabp1Q9JLK7 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Cabp1Q9JLK7 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Cabp1Q9JLK7 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Cabp1Q9JLK7 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Cabp1Q9JLK7 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Cabp1Q9JLK7 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Cabp1Q9JLK7 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Cabp1Q9JLK7 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Cabp1Q9JLK7 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Cabp1Q9JLK7 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Cabp1Q9JLK7 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Cabp1Q9JLK7 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Cabp1Q9JLK7 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Cabp1Q9JLK7 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Cabp1Q9JLK7 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Cabp1Q9JLK7 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Cabp1Q9JLK7 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Cabp1Q9JLK7 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Cabp1Q9JLK7 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Cabp1Q9JLK7 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Cabp1Q9JLK7 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
Cabp1Q9JLK7 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Cabp1Q9JLK7 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Cabp1Q9JLK7 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Cabp1Q9JLK7 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Cabp1Q9JLK7 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Cabp1Q9JLK7 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Cabp1Q9JLK7 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Cabp1Q9JLK7 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Cabp1Q9JLK7 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Cabp1Q9JLK7 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Cabp1Q9JLK7 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Cabp1Q9JLK7 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Cabp1Q9JLK7 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Cabp1Q9JLK7 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Cabp1Q9JLK7 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Cabp1Q9JLK7 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC28■■■□□ 2.07
Cabp1Q9JLK7 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Cabp1Q9JLK7 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Cabp1Q9JLK7 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
Cabp1Q9JLK7 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Cabp1Q9JLK7 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Cabp1Q9JLK7 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Cabp1Q9JLK7 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Cabp1Q9JLK7 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
Cabp1Q9JLK7 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms