Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLB4

Cubn, Cubilin, mousemouse

Predictions only

Length 3,623 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CubnQ9JLB4 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CubnQ9JLB4 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CubnQ9JLB4 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CubnQ9JLB4 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CubnQ9JLB4 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CubnQ9JLB4 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CubnQ9JLB4 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CubnQ9JLB4 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CubnQ9JLB4 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CubnQ9JLB4 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CubnQ9JLB4 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CubnQ9JLB4 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CubnQ9JLB4 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CubnQ9JLB4 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CubnQ9JLB4 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CubnQ9JLB4 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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CubnQ9JLB4 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CubnQ9JLB4 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CubnQ9JLB4 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
CubnQ9JLB4 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CubnQ9JLB4 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CubnQ9JLB4 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CubnQ9JLB4 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CubnQ9JLB4 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
CubnQ9JLB4 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CubnQ9JLB4 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CubnQ9JLB4 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CubnQ9JLB4 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
CubnQ9JLB4 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CubnQ9JLB4 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CubnQ9JLB4 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
CubnQ9JLB4 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CubnQ9JLB4 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CubnQ9JLB4 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CubnQ9JLB4 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CubnQ9JLB4 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CubnQ9JLB4 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CubnQ9JLB4 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
CubnQ9JLB4 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
CubnQ9JLB4 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CubnQ9JLB4 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
CubnQ9JLB4 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CubnQ9JLB4 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CubnQ9JLB4 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CubnQ9JLB4 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CubnQ9JLB4 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CubnQ9JLB4 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CubnQ9JLB4 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CubnQ9JLB4 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CubnQ9JLB4 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
CubnQ9JLB4 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CubnQ9JLB4 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CubnQ9JLB4 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.01
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CubnQ9JLB4 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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CubnQ9JLB4 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
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CubnQ9JLB4 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
CubnQ9JLB4 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
CubnQ9JLB4 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
CubnQ9JLB4 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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CubnQ9JLB4 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CubnQ9JLB4 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CubnQ9JLB4 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CubnQ9JLB4 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CubnQ9JLB4 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CubnQ9JLB4 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CubnQ9JLB4 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CubnQ9JLB4 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CubnQ9JLB4 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CubnQ9JLB4 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CubnQ9JLB4 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CubnQ9JLB4 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CubnQ9JLB4 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CubnQ9JLB4 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CubnQ9JLB4 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CubnQ9JLB4 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CubnQ9JLB4 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CubnQ9JLB4 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CubnQ9JLB4 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CubnQ9JLB4 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CubnQ9JLB4 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CubnQ9JLB4 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CubnQ9JLB4 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CubnQ9JLB4 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
CubnQ9JLB4 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
CubnQ9JLB4 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CubnQ9JLB4 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CubnQ9JLB4 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CubnQ9JLB4 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CubnQ9JLB4 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CubnQ9JLB4 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CubnQ9JLB4 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
CubnQ9JLB4 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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