Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJF6

Efcc1, EF-hand and coiled-coil domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 558 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Efcc1Q9JJF6 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Efcc1Q9JJF6 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Efcc1Q9JJF6 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Efcc1Q9JJF6 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Efcc1Q9JJF6 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Efcc1Q9JJF6 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Efcc1Q9JJF6 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Efcc1Q9JJF6 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Efcc1Q9JJF6 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Efcc1Q9JJF6 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Efcc1Q9JJF6 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Efcc1Q9JJF6 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Efcc1Q9JJF6 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Efcc1Q9JJF6 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Efcc1Q9JJF6 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Efcc1Q9JJF6 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Efcc1Q9JJF6 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Efcc1Q9JJF6 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Efcc1Q9JJF6 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Efcc1Q9JJF6 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Efcc1Q9JJF6 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Efcc1Q9JJF6 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Efcc1Q9JJF6 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Efcc1Q9JJF6 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Efcc1Q9JJF6 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Efcc1Q9JJF6 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Efcc1Q9JJF6 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Efcc1Q9JJF6 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Efcc1Q9JJF6 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Efcc1Q9JJF6 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Efcc1Q9JJF6 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Efcc1Q9JJF6 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Efcc1Q9JJF6 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Efcc1Q9JJF6 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Efcc1Q9JJF6 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Efcc1Q9JJF6 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Efcc1Q9JJF6 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Efcc1Q9JJF6 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Efcc1Q9JJF6 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Efcc1Q9JJF6 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Efcc1Q9JJF6 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Efcc1Q9JJF6 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Efcc1Q9JJF6 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Efcc1Q9JJF6 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Efcc1Q9JJF6 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Efcc1Q9JJF6 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Efcc1Q9JJF6 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Efcc1Q9JJF6 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Efcc1Q9JJF6 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Efcc1Q9JJF6 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Efcc1Q9JJF6 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Efcc1Q9JJF6 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Efcc1Q9JJF6 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Efcc1Q9JJF6 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Efcc1Q9JJF6 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Efcc1Q9JJF6 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Efcc1Q9JJF6 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Efcc1Q9JJF6 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Efcc1Q9JJF6 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Efcc1Q9JJF6 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Efcc1Q9JJF6 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Efcc1Q9JJF6 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Efcc1Q9JJF6 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Efcc1Q9JJF6 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Efcc1Q9JJF6 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Efcc1Q9JJF6 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Efcc1Q9JJF6 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Efcc1Q9JJF6 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Efcc1Q9JJF6 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Efcc1Q9JJF6 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Efcc1Q9JJF6 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Efcc1Q9JJF6 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Efcc1Q9JJF6 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Efcc1Q9JJF6 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Efcc1Q9JJF6 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Efcc1Q9JJF6 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Efcc1Q9JJF6 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Efcc1Q9JJF6 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Efcc1Q9JJF6 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Efcc1Q9JJF6 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Efcc1Q9JJF6 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Efcc1Q9JJF6 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Efcc1Q9JJF6 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Efcc1Q9JJF6 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Efcc1Q9JJF6 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Efcc1Q9JJF6 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Efcc1Q9JJF6 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Efcc1Q9JJF6 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Efcc1Q9JJF6 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Efcc1Q9JJF6 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Efcc1Q9JJF6 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Efcc1Q9JJF6 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Efcc1Q9JJF6 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Efcc1Q9JJF6 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Efcc1Q9JJF6 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Efcc1Q9JJF6 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Efcc1Q9JJF6 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Efcc1Q9JJF6 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Efcc1Q9JJF6 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Efcc1Q9JJF6 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms