Protein–RNA interactions for Protein: Q9JHW4

Eefsec, Selenocysteine-specific elongation factor, mousemouse

Predictions only

Length 583 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EefsecQ9JHW4 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
EefsecQ9JHW4 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
EefsecQ9JHW4 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
EefsecQ9JHW4 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
EefsecQ9JHW4 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
EefsecQ9JHW4 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
EefsecQ9JHW4 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
EefsecQ9JHW4 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
EefsecQ9JHW4 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
EefsecQ9JHW4 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
EefsecQ9JHW4 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
EefsecQ9JHW4 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
EefsecQ9JHW4 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
EefsecQ9JHW4 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
EefsecQ9JHW4 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
EefsecQ9JHW4 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
EefsecQ9JHW4 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
EefsecQ9JHW4 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
EefsecQ9JHW4 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
EefsecQ9JHW4 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
EefsecQ9JHW4 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
EefsecQ9JHW4 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
EefsecQ9JHW4 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
EefsecQ9JHW4 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
EefsecQ9JHW4 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
EefsecQ9JHW4 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
EefsecQ9JHW4 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
EefsecQ9JHW4 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
EefsecQ9JHW4 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
EefsecQ9JHW4 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
EefsecQ9JHW4 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
EefsecQ9JHW4 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
EefsecQ9JHW4 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
EefsecQ9JHW4 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
EefsecQ9JHW4 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
EefsecQ9JHW4 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
EefsecQ9JHW4 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
EefsecQ9JHW4 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
EefsecQ9JHW4 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
EefsecQ9JHW4 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
EefsecQ9JHW4 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
EefsecQ9JHW4 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
EefsecQ9JHW4 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
EefsecQ9JHW4 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
EefsecQ9JHW4 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
EefsecQ9JHW4 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
EefsecQ9JHW4 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
EefsecQ9JHW4 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
EefsecQ9JHW4 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
EefsecQ9JHW4 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
EefsecQ9JHW4 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
EefsecQ9JHW4 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
EefsecQ9JHW4 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
EefsecQ9JHW4 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
EefsecQ9JHW4 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
EefsecQ9JHW4 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
EefsecQ9JHW4 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
EefsecQ9JHW4 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
EefsecQ9JHW4 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
EefsecQ9JHW4 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
EefsecQ9JHW4 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
EefsecQ9JHW4 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
EefsecQ9JHW4 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
EefsecQ9JHW4 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
EefsecQ9JHW4 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
EefsecQ9JHW4 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
EefsecQ9JHW4 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
EefsecQ9JHW4 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
EefsecQ9JHW4 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
EefsecQ9JHW4 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
EefsecQ9JHW4 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
EefsecQ9JHW4 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
EefsecQ9JHW4 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
EefsecQ9JHW4 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
EefsecQ9JHW4 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
EefsecQ9JHW4 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
EefsecQ9JHW4 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
EefsecQ9JHW4 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
EefsecQ9JHW4 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
EefsecQ9JHW4 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
EefsecQ9JHW4 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
EefsecQ9JHW4 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
EefsecQ9JHW4 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
EefsecQ9JHW4 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
EefsecQ9JHW4 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
EefsecQ9JHW4 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
EefsecQ9JHW4 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
EefsecQ9JHW4 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
EefsecQ9JHW4 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
EefsecQ9JHW4 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
EefsecQ9JHW4 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
EefsecQ9JHW4 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
EefsecQ9JHW4 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
EefsecQ9JHW4 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
EefsecQ9JHW4 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
EefsecQ9JHW4 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
EefsecQ9JHW4 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
EefsecQ9JHW4 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
EefsecQ9JHW4 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
EefsecQ9JHW4 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.7 ms