Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESK9

Rb1cc1, RB1-inducible coiled-coil protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,588 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rb1cc1Q9ESK9 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
Rb1cc1Q9ESK9 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
Rb1cc1Q9ESK9 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.24
Rb1cc1Q9ESK9 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.24
Rb1cc1Q9ESK9 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC35.26■■■■□ 3.24
Rb1cc1Q9ESK9 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC35.26■■■■□ 3.24
Rb1cc1Q9ESK9 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC35.26■■■■□ 3.24
Rb1cc1Q9ESK9 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.23
Rb1cc1Q9ESK9 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.23
Rb1cc1Q9ESK9 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.23
Rb1cc1Q9ESK9 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC35.25■■■■□ 3.23
Rb1cc1Q9ESK9 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
Rb1cc1Q9ESK9 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
Rb1cc1Q9ESK9 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
Rb1cc1Q9ESK9 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
Rb1cc1Q9ESK9 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC35.25■■■■□ 3.23
Rb1cc1Q9ESK9 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
Rb1cc1Q9ESK9 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
Rb1cc1Q9ESK9 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
Rb1cc1Q9ESK9 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
Rb1cc1Q9ESK9 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC35.25■■■■□ 3.23
Rb1cc1Q9ESK9 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.25■■■■□ 3.23
Rb1cc1Q9ESK9 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC35.25■■■■□ 3.23
Rb1cc1Q9ESK9 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC35.25■■■■□ 3.23
Rb1cc1Q9ESK9 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.24■■■■□ 3.23
Rb1cc1Q9ESK9 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
Rb1cc1Q9ESK9 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.24■■■■□ 3.23
Rb1cc1Q9ESK9 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC35.24■■■■□ 3.23
Rb1cc1Q9ESK9 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
Rb1cc1Q9ESK9 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
Rb1cc1Q9ESK9 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC35.23■■■■□ 3.23
Rb1cc1Q9ESK9 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.23■■■■□ 3.23
Rb1cc1Q9ESK9 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
Rb1cc1Q9ESK9 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
Rb1cc1Q9ESK9 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
Rb1cc1Q9ESK9 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
Rb1cc1Q9ESK9 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
Rb1cc1Q9ESK9 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
Rb1cc1Q9ESK9 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
Rb1cc1Q9ESK9 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
Rb1cc1Q9ESK9 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
Rb1cc1Q9ESK9 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
Rb1cc1Q9ESK9 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
Rb1cc1Q9ESK9 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
Rb1cc1Q9ESK9 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC35.21■■■■□ 3.23
Rb1cc1Q9ESK9 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC35.21■■■■□ 3.23
Rb1cc1Q9ESK9 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
Rb1cc1Q9ESK9 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.2■■■■□ 3.23
Rb1cc1Q9ESK9 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC35.2■■■■□ 3.23
Rb1cc1Q9ESK9 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC35.2■■■■□ 3.23
Rb1cc1Q9ESK9 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
Rb1cc1Q9ESK9 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
Rb1cc1Q9ESK9 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
Rb1cc1Q9ESK9 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
Rb1cc1Q9ESK9 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
Rb1cc1Q9ESK9 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC35.19■■■■□ 3.22
Rb1cc1Q9ESK9 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
Rb1cc1Q9ESK9 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
Rb1cc1Q9ESK9 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.18■■■■□ 3.22
Rb1cc1Q9ESK9 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.18■■■■□ 3.22
Rb1cc1Q9ESK9 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.18■■■■□ 3.22
Rb1cc1Q9ESK9 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC35.18■■■■□ 3.22
Rb1cc1Q9ESK9 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.18■■■■□ 3.22
Rb1cc1Q9ESK9 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.18■■■■□ 3.22
Rb1cc1Q9ESK9 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.18■■■■□ 3.22
Rb1cc1Q9ESK9 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC35.18■■■■□ 3.22
Rb1cc1Q9ESK9 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
Rb1cc1Q9ESK9 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
Rb1cc1Q9ESK9 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
Rb1cc1Q9ESK9 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
Rb1cc1Q9ESK9 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.18■■■■□ 3.22
Rb1cc1Q9ESK9 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.17■■■■□ 3.22
Rb1cc1Q9ESK9 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC35.17■■■■□ 3.22
Rb1cc1Q9ESK9 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC35.17■■■■□ 3.22
Rb1cc1Q9ESK9 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC35.17■■■■□ 3.22
Rb1cc1Q9ESK9 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
Rb1cc1Q9ESK9 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
Rb1cc1Q9ESK9 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
Rb1cc1Q9ESK9 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
Rb1cc1Q9ESK9 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
Rb1cc1Q9ESK9 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC35.17■■■■□ 3.22
Rb1cc1Q9ESK9 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
Rb1cc1Q9ESK9 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
Rb1cc1Q9ESK9 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
Rb1cc1Q9ESK9 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC35.16■■■■□ 3.22
Rb1cc1Q9ESK9 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
Rb1cc1Q9ESK9 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC35.16■■■■□ 3.22
Rb1cc1Q9ESK9 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC35.16■■■■□ 3.22
Rb1cc1Q9ESK9 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
Rb1cc1Q9ESK9 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
Rb1cc1Q9ESK9 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC35.15■■■■□ 3.22
Rb1cc1Q9ESK9 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
Rb1cc1Q9ESK9 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC35.15■■■■□ 3.22
Rb1cc1Q9ESK9 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
Rb1cc1Q9ESK9 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.14■■■■□ 3.22
Rb1cc1Q9ESK9 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC35.14■■■■□ 3.22
Rb1cc1Q9ESK9 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
Rb1cc1Q9ESK9 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC35.14■■■■□ 3.22
Rb1cc1Q9ESK9 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC35.14■■■■□ 3.22
Rb1cc1Q9ESK9 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC35.14■■■■□ 3.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.7 ms