Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES56

Trappc4, Trafficking protein particle complex subunit 4, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc4Q9ES56 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Trappc4Q9ES56 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Trappc4Q9ES56 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Trappc4Q9ES56 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Trappc4Q9ES56 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Trappc4Q9ES56 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Trappc4Q9ES56 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Trappc4Q9ES56 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Trappc4Q9ES56 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Trappc4Q9ES56 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Trappc4Q9ES56 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Trappc4Q9ES56 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Trappc4Q9ES56 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Trappc4Q9ES56 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Trappc4Q9ES56 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Trappc4Q9ES56 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Trappc4Q9ES56 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Trappc4Q9ES56 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Trappc4Q9ES56 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Trappc4Q9ES56 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Trappc4Q9ES56 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Trappc4Q9ES56 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Trappc4Q9ES56 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Trappc4Q9ES56 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Trappc4Q9ES56 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Trappc4Q9ES56 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Trappc4Q9ES56 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Trappc4Q9ES56 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Trappc4Q9ES56 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Trappc4Q9ES56 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Trappc4Q9ES56 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Trappc4Q9ES56 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Trappc4Q9ES56 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Trappc4Q9ES56 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Trappc4Q9ES56 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Trappc4Q9ES56 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Trappc4Q9ES56 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Trappc4Q9ES56 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Trappc4Q9ES56 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Trappc4Q9ES56 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Trappc4Q9ES56 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Trappc4Q9ES56 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Trappc4Q9ES56 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Trappc4Q9ES56 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Trappc4Q9ES56 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Trappc4Q9ES56 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Trappc4Q9ES56 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Trappc4Q9ES56 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Trappc4Q9ES56 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Trappc4Q9ES56 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Trappc4Q9ES56 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Trappc4Q9ES56 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Trappc4Q9ES56 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Trappc4Q9ES56 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Trappc4Q9ES56 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Trappc4Q9ES56 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Trappc4Q9ES56 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Trappc4Q9ES56 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Trappc4Q9ES56 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Trappc4Q9ES56 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Trappc4Q9ES56 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Trappc4Q9ES56 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Trappc4Q9ES56 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Trappc4Q9ES56 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Trappc4Q9ES56 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Trappc4Q9ES56 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Trappc4Q9ES56 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Trappc4Q9ES56 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Trappc4Q9ES56 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Trappc4Q9ES56 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Trappc4Q9ES56 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Trappc4Q9ES56 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Trappc4Q9ES56 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Trappc4Q9ES56 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Trappc4Q9ES56 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Trappc4Q9ES56 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Trappc4Q9ES56 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Trappc4Q9ES56 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Trappc4Q9ES56 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Trappc4Q9ES56 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Trappc4Q9ES56 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Trappc4Q9ES56 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Trappc4Q9ES56 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Trappc4Q9ES56 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Trappc4Q9ES56 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Trappc4Q9ES56 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Trappc4Q9ES56 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Trappc4Q9ES56 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Trappc4Q9ES56 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Trappc4Q9ES56 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Trappc4Q9ES56 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Trappc4Q9ES56 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Trappc4Q9ES56 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Trappc4Q9ES56 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Trappc4Q9ES56 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Trappc4Q9ES56 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Trappc4Q9ES56 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Trappc4Q9ES56 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Trappc4Q9ES56 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Trappc4Q9ES56 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.4 ms