Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQH7

Ndst3, Bifunctional heparan sulfate N-deacetylase/N-sulfotransferase 3, mousemouse

Predictions only

Length 873 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndst3Q9EQH7 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
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Ndst3Q9EQH7 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ndst3Q9EQH7 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
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Ndst3Q9EQH7 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
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Ndst3Q9EQH7 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
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Ndst3Q9EQH7 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ndst3Q9EQH7 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ndst3Q9EQH7 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
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Ndst3Q9EQH7 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ndst3Q9EQH7 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ndst3Q9EQH7 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Ndst3Q9EQH7 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ndst3Q9EQH7 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ndst3Q9EQH7 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ndst3Q9EQH7 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms