Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPU0

Upf1, Regulator of nonsense transcripts 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,124 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Upf1Q9EPU0 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Upf1Q9EPU0 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Upf1Q9EPU0 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Upf1Q9EPU0 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Upf1Q9EPU0 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Upf1Q9EPU0 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Upf1Q9EPU0 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Upf1Q9EPU0 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Upf1Q9EPU0 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Upf1Q9EPU0 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Upf1Q9EPU0 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Upf1Q9EPU0 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Upf1Q9EPU0 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Upf1Q9EPU0 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Upf1Q9EPU0 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Upf1Q9EPU0 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Upf1Q9EPU0 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Upf1Q9EPU0 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Upf1Q9EPU0 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Upf1Q9EPU0 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Upf1Q9EPU0 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Upf1Q9EPU0 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Upf1Q9EPU0 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Upf1Q9EPU0 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Upf1Q9EPU0 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Upf1Q9EPU0 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Upf1Q9EPU0 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Upf1Q9EPU0 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Upf1Q9EPU0 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Upf1Q9EPU0 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Upf1Q9EPU0 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Upf1Q9EPU0 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Upf1Q9EPU0 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Upf1Q9EPU0 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Upf1Q9EPU0 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Upf1Q9EPU0 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Upf1Q9EPU0 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Upf1Q9EPU0 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Upf1Q9EPU0 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Upf1Q9EPU0 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Upf1Q9EPU0 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Upf1Q9EPU0 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Upf1Q9EPU0 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Upf1Q9EPU0 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Upf1Q9EPU0 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Upf1Q9EPU0 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Upf1Q9EPU0 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Upf1Q9EPU0 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Upf1Q9EPU0 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Upf1Q9EPU0 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Upf1Q9EPU0 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Upf1Q9EPU0 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Upf1Q9EPU0 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Upf1Q9EPU0 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Upf1Q9EPU0 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Upf1Q9EPU0 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Upf1Q9EPU0 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Upf1Q9EPU0 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Upf1Q9EPU0 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Upf1Q9EPU0 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Upf1Q9EPU0 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Upf1Q9EPU0 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Upf1Q9EPU0 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Upf1Q9EPU0 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Upf1Q9EPU0 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Upf1Q9EPU0 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Upf1Q9EPU0 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Upf1Q9EPU0 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Upf1Q9EPU0 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Upf1Q9EPU0 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Upf1Q9EPU0 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Upf1Q9EPU0 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Upf1Q9EPU0 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Upf1Q9EPU0 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Upf1Q9EPU0 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Upf1Q9EPU0 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Upf1Q9EPU0 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Upf1Q9EPU0 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Upf1Q9EPU0 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Upf1Q9EPU0 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Upf1Q9EPU0 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Upf1Q9EPU0 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Upf1Q9EPU0 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Upf1Q9EPU0 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Upf1Q9EPU0 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Upf1Q9EPU0 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Upf1Q9EPU0 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Upf1Q9EPU0 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Upf1Q9EPU0 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Upf1Q9EPU0 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Upf1Q9EPU0 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Upf1Q9EPU0 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Upf1Q9EPU0 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Upf1Q9EPU0 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Upf1Q9EPU0 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Upf1Q9EPU0 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Upf1Q9EPU0 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Upf1Q9EPU0 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Upf1Q9EPU0 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Upf1Q9EPU0 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms