Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCD2

Xab2, Pre-mRNA-splicing factor SYF1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 855 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xab2Q9DCD2 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Xab2Q9DCD2 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Xab2Q9DCD2 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Xab2Q9DCD2 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Xab2Q9DCD2 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Xab2Q9DCD2 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Xab2Q9DCD2 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Xab2Q9DCD2 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Xab2Q9DCD2 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Xab2Q9DCD2 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Xab2Q9DCD2 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Xab2Q9DCD2 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Xab2Q9DCD2 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Xab2Q9DCD2 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Xab2Q9DCD2 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Xab2Q9DCD2 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Xab2Q9DCD2 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Xab2Q9DCD2 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Xab2Q9DCD2 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Xab2Q9DCD2 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Xab2Q9DCD2 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Xab2Q9DCD2 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Xab2Q9DCD2 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Xab2Q9DCD2 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Xab2Q9DCD2 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Xab2Q9DCD2 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Xab2Q9DCD2 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Xab2Q9DCD2 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Xab2Q9DCD2 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Xab2Q9DCD2 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Xab2Q9DCD2 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Xab2Q9DCD2 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Xab2Q9DCD2 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Xab2Q9DCD2 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Xab2Q9DCD2 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Xab2Q9DCD2 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Xab2Q9DCD2 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Xab2Q9DCD2 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Xab2Q9DCD2 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Xab2Q9DCD2 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Xab2Q9DCD2 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Xab2Q9DCD2 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Xab2Q9DCD2 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Xab2Q9DCD2 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Xab2Q9DCD2 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Xab2Q9DCD2 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Xab2Q9DCD2 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Xab2Q9DCD2 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Xab2Q9DCD2 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Xab2Q9DCD2 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Xab2Q9DCD2 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Xab2Q9DCD2 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Xab2Q9DCD2 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Xab2Q9DCD2 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Xab2Q9DCD2 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Xab2Q9DCD2 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Xab2Q9DCD2 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Xab2Q9DCD2 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Xab2Q9DCD2 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Xab2Q9DCD2 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Xab2Q9DCD2 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Xab2Q9DCD2 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Xab2Q9DCD2 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Xab2Q9DCD2 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Xab2Q9DCD2 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Xab2Q9DCD2 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Xab2Q9DCD2 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Xab2Q9DCD2 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Xab2Q9DCD2 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Xab2Q9DCD2 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Xab2Q9DCD2 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Xab2Q9DCD2 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Xab2Q9DCD2 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Xab2Q9DCD2 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Xab2Q9DCD2 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Xab2Q9DCD2 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Xab2Q9DCD2 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Xab2Q9DCD2 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Xab2Q9DCD2 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Xab2Q9DCD2 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Xab2Q9DCD2 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Xab2Q9DCD2 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Xab2Q9DCD2 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Xab2Q9DCD2 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Xab2Q9DCD2 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Xab2Q9DCD2 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Xab2Q9DCD2 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Xab2Q9DCD2 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Xab2Q9DCD2 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Xab2Q9DCD2 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Xab2Q9DCD2 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Xab2Q9DCD2 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Xab2Q9DCD2 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Xab2Q9DCD2 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Xab2Q9DCD2 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Xab2Q9DCD2 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Xab2Q9DCD2 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Xab2Q9DCD2 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Xab2Q9DCD2 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Xab2Q9DCD2 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms