Protein–RNA interactions for Protein: Q9DAX3

Erv3, Endogenous retroviral sequence 3, mousemouse

Predictions only

Length 200 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Erv3Q9DAX3 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Erv3Q9DAX3 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Erv3Q9DAX3 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Erv3Q9DAX3 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Erv3Q9DAX3 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Erv3Q9DAX3 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Erv3Q9DAX3 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Erv3Q9DAX3 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Erv3Q9DAX3 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Erv3Q9DAX3 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Erv3Q9DAX3 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Erv3Q9DAX3 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Erv3Q9DAX3 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Erv3Q9DAX3 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Erv3Q9DAX3 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Erv3Q9DAX3 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Erv3Q9DAX3 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Erv3Q9DAX3 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Erv3Q9DAX3 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Erv3Q9DAX3 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Erv3Q9DAX3 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Erv3Q9DAX3 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Erv3Q9DAX3 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Erv3Q9DAX3 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Erv3Q9DAX3 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Erv3Q9DAX3 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Erv3Q9DAX3 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Erv3Q9DAX3 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Erv3Q9DAX3 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Erv3Q9DAX3 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Erv3Q9DAX3 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Erv3Q9DAX3 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Erv3Q9DAX3 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Erv3Q9DAX3 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Erv3Q9DAX3 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Erv3Q9DAX3 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Erv3Q9DAX3 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Erv3Q9DAX3 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Erv3Q9DAX3 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Erv3Q9DAX3 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Erv3Q9DAX3 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Erv3Q9DAX3 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Erv3Q9DAX3 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Erv3Q9DAX3 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Erv3Q9DAX3 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Erv3Q9DAX3 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Erv3Q9DAX3 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Erv3Q9DAX3 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Erv3Q9DAX3 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
Erv3Q9DAX3 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Erv3Q9DAX3 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Erv3Q9DAX3 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Erv3Q9DAX3 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Erv3Q9DAX3 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Erv3Q9DAX3 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Erv3Q9DAX3 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Erv3Q9DAX3 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Erv3Q9DAX3 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Erv3Q9DAX3 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Erv3Q9DAX3 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Erv3Q9DAX3 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Erv3Q9DAX3 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Erv3Q9DAX3 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Erv3Q9DAX3 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Erv3Q9DAX3 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Erv3Q9DAX3 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Erv3Q9DAX3 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Erv3Q9DAX3 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Erv3Q9DAX3 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Erv3Q9DAX3 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Erv3Q9DAX3 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Erv3Q9DAX3 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Erv3Q9DAX3 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Erv3Q9DAX3 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Erv3Q9DAX3 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Erv3Q9DAX3 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Erv3Q9DAX3 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Erv3Q9DAX3 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Erv3Q9DAX3 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Erv3Q9DAX3 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Erv3Q9DAX3 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Erv3Q9DAX3 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Erv3Q9DAX3 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Erv3Q9DAX3 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Erv3Q9DAX3 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Erv3Q9DAX3 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Erv3Q9DAX3 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Erv3Q9DAX3 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Erv3Q9DAX3 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Erv3Q9DAX3 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Erv3Q9DAX3 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Erv3Q9DAX3 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Erv3Q9DAX3 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Erv3Q9DAX3 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Erv3Q9DAX3 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Erv3Q9DAX3 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Erv3Q9DAX3 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Erv3Q9DAX3 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Erv3Q9DAX3 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Erv3Q9DAX3 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms