Protein–RNA interactions for Protein: Q9D783

Klhl40, Kelch-like protein 40, mousemouse

Predictions only

Length 621 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhl40Q9D783 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Klhl40Q9D783 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Klhl40Q9D783 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Klhl40Q9D783 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Klhl40Q9D783 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Klhl40Q9D783 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Klhl40Q9D783 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Klhl40Q9D783 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Klhl40Q9D783 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Klhl40Q9D783 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Klhl40Q9D783 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Klhl40Q9D783 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Klhl40Q9D783 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Klhl40Q9D783 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
Klhl40Q9D783 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Klhl40Q9D783 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
Klhl40Q9D783 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Klhl40Q9D783 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Klhl40Q9D783 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Klhl40Q9D783 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
Klhl40Q9D783 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Klhl40Q9D783 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Klhl40Q9D783 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
Klhl40Q9D783 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Klhl40Q9D783 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Klhl40Q9D783 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Klhl40Q9D783 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Klhl40Q9D783 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Klhl40Q9D783 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Klhl40Q9D783 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Klhl40Q9D783 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Klhl40Q9D783 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Klhl40Q9D783 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Klhl40Q9D783 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Klhl40Q9D783 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Klhl40Q9D783 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Klhl40Q9D783 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Klhl40Q9D783 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Klhl40Q9D783 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Klhl40Q9D783 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Klhl40Q9D783 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Klhl40Q9D783 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Klhl40Q9D783 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Klhl40Q9D783 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Klhl40Q9D783 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Klhl40Q9D783 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Klhl40Q9D783 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Klhl40Q9D783 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Klhl40Q9D783 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Klhl40Q9D783 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Klhl40Q9D783 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Klhl40Q9D783 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Klhl40Q9D783 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Klhl40Q9D783 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Klhl40Q9D783 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Klhl40Q9D783 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Klhl40Q9D783 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Klhl40Q9D783 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Klhl40Q9D783 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Klhl40Q9D783 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Klhl40Q9D783 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Klhl40Q9D783 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Klhl40Q9D783 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Klhl40Q9D783 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Klhl40Q9D783 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Klhl40Q9D783 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Klhl40Q9D783 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Klhl40Q9D783 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Klhl40Q9D783 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Klhl40Q9D783 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Klhl40Q9D783 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Klhl40Q9D783 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Klhl40Q9D783 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Klhl40Q9D783 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Klhl40Q9D783 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Klhl40Q9D783 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Klhl40Q9D783 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Klhl40Q9D783 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Klhl40Q9D783 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Klhl40Q9D783 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Klhl40Q9D783 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
Klhl40Q9D783 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Klhl40Q9D783 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Klhl40Q9D783 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Klhl40Q9D783 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Klhl40Q9D783 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Klhl40Q9D783 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Klhl40Q9D783 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Klhl40Q9D783 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Klhl40Q9D783 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
Klhl40Q9D783 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Klhl40Q9D783 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Klhl40Q9D783 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Klhl40Q9D783 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
Klhl40Q9D783 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Klhl40Q9D783 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Klhl40Q9D783 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
Klhl40Q9D783 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Klhl40Q9D783 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Klhl40Q9D783 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms