Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6G9

Cmtm5, CKLF-like MARVEL transmembrane domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 156 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cmtm5Q9D6G9 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cmtm5Q9D6G9 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cmtm5Q9D6G9 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cmtm5Q9D6G9 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cmtm5Q9D6G9 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cmtm5Q9D6G9 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cmtm5Q9D6G9 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cmtm5Q9D6G9 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cmtm5Q9D6G9 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cmtm5Q9D6G9 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cmtm5Q9D6G9 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cmtm5Q9D6G9 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cmtm5Q9D6G9 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Cmtm5Q9D6G9 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.03
Cmtm5Q9D6G9 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Cmtm5Q9D6G9 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Cmtm5Q9D6G9 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cmtm5Q9D6G9 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cmtm5Q9D6G9 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cmtm5Q9D6G9 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cmtm5Q9D6G9 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cmtm5Q9D6G9 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Cmtm5Q9D6G9 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Cmtm5Q9D6G9 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Cmtm5Q9D6G9 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cmtm5Q9D6G9 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Cmtm5Q9D6G9 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Cmtm5Q9D6G9 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Cmtm5Q9D6G9 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Cmtm5Q9D6G9 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cmtm5Q9D6G9 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cmtm5Q9D6G9 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Cmtm5Q9D6G9 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cmtm5Q9D6G9 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cmtm5Q9D6G9 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cmtm5Q9D6G9 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cmtm5Q9D6G9 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cmtm5Q9D6G9 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cmtm5Q9D6G9 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cmtm5Q9D6G9 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cmtm5Q9D6G9 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cmtm5Q9D6G9 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cmtm5Q9D6G9 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cmtm5Q9D6G9 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cmtm5Q9D6G9 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cmtm5Q9D6G9 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cmtm5Q9D6G9 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cmtm5Q9D6G9 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cmtm5Q9D6G9 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cmtm5Q9D6G9 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cmtm5Q9D6G9 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cmtm5Q9D6G9 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cmtm5Q9D6G9 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cmtm5Q9D6G9 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cmtm5Q9D6G9 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cmtm5Q9D6G9 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cmtm5Q9D6G9 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cmtm5Q9D6G9 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cmtm5Q9D6G9 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cmtm5Q9D6G9 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cmtm5Q9D6G9 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cmtm5Q9D6G9 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cmtm5Q9D6G9 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cmtm5Q9D6G9 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cmtm5Q9D6G9 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cmtm5Q9D6G9 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cmtm5Q9D6G9 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cmtm5Q9D6G9 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cmtm5Q9D6G9 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cmtm5Q9D6G9 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Cmtm5Q9D6G9 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Cmtm5Q9D6G9 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cmtm5Q9D6G9 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cmtm5Q9D6G9 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cmtm5Q9D6G9 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cmtm5Q9D6G9 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cmtm5Q9D6G9 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cmtm5Q9D6G9 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cmtm5Q9D6G9 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Cmtm5Q9D6G9 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cmtm5Q9D6G9 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cmtm5Q9D6G9 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cmtm5Q9D6G9 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cmtm5Q9D6G9 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cmtm5Q9D6G9 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cmtm5Q9D6G9 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cmtm5Q9D6G9 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cmtm5Q9D6G9 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cmtm5Q9D6G9 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cmtm5Q9D6G9 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cmtm5Q9D6G9 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cmtm5Q9D6G9 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cmtm5Q9D6G9 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cmtm5Q9D6G9 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cmtm5Q9D6G9 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cmtm5Q9D6G9 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cmtm5Q9D6G9 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Cmtm5Q9D6G9 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cmtm5Q9D6G9 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cmtm5Q9D6G9 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms