Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5Y1

Ccdc39, Coiled-coil domain-containing protein 39, mousemouse

Predictions only

Length 937 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc39Q9D5Y1 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ccdc39Q9D5Y1 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ccdc39Q9D5Y1 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ccdc39Q9D5Y1 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ccdc39Q9D5Y1 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ccdc39Q9D5Y1 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ccdc39Q9D5Y1 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ccdc39Q9D5Y1 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccdc39Q9D5Y1 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccdc39Q9D5Y1 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccdc39Q9D5Y1 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccdc39Q9D5Y1 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccdc39Q9D5Y1 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccdc39Q9D5Y1 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccdc39Q9D5Y1 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccdc39Q9D5Y1 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccdc39Q9D5Y1 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccdc39Q9D5Y1 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccdc39Q9D5Y1 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccdc39Q9D5Y1 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccdc39Q9D5Y1 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccdc39Q9D5Y1 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccdc39Q9D5Y1 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccdc39Q9D5Y1 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccdc39Q9D5Y1 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccdc39Q9D5Y1 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccdc39Q9D5Y1 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ccdc39Q9D5Y1 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ccdc39Q9D5Y1 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ccdc39Q9D5Y1 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ccdc39Q9D5Y1 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ccdc39Q9D5Y1 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ccdc39Q9D5Y1 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ccdc39Q9D5Y1 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ccdc39Q9D5Y1 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ccdc39Q9D5Y1 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Ccdc39Q9D5Y1 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccdc39Q9D5Y1 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccdc39Q9D5Y1 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccdc39Q9D5Y1 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccdc39Q9D5Y1 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccdc39Q9D5Y1 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccdc39Q9D5Y1 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccdc39Q9D5Y1 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccdc39Q9D5Y1 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccdc39Q9D5Y1 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccdc39Q9D5Y1 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccdc39Q9D5Y1 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccdc39Q9D5Y1 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccdc39Q9D5Y1 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccdc39Q9D5Y1 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccdc39Q9D5Y1 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccdc39Q9D5Y1 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccdc39Q9D5Y1 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccdc39Q9D5Y1 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccdc39Q9D5Y1 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccdc39Q9D5Y1 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccdc39Q9D5Y1 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccdc39Q9D5Y1 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccdc39Q9D5Y1 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccdc39Q9D5Y1 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccdc39Q9D5Y1 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccdc39Q9D5Y1 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccdc39Q9D5Y1 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccdc39Q9D5Y1 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccdc39Q9D5Y1 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccdc39Q9D5Y1 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccdc39Q9D5Y1 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccdc39Q9D5Y1 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccdc39Q9D5Y1 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccdc39Q9D5Y1 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccdc39Q9D5Y1 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccdc39Q9D5Y1 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccdc39Q9D5Y1 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccdc39Q9D5Y1 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccdc39Q9D5Y1 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccdc39Q9D5Y1 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccdc39Q9D5Y1 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccdc39Q9D5Y1 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccdc39Q9D5Y1 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccdc39Q9D5Y1 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccdc39Q9D5Y1 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccdc39Q9D5Y1 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccdc39Q9D5Y1 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccdc39Q9D5Y1 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccdc39Q9D5Y1 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccdc39Q9D5Y1 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccdc39Q9D5Y1 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccdc39Q9D5Y1 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccdc39Q9D5Y1 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccdc39Q9D5Y1 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccdc39Q9D5Y1 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Ccdc39Q9D5Y1 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccdc39Q9D5Y1 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccdc39Q9D5Y1 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccdc39Q9D5Y1 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccdc39Q9D5Y1 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccdc39Q9D5Y1 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccdc39Q9D5Y1 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccdc39Q9D5Y1 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms