Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3U0

Pus10, Putative tRNA pseudouridine synthase Pus10, mousemouse

Predictions only

Length 527 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pus10Q9D3U0 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Pus10Q9D3U0 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Pus10Q9D3U0 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Pus10Q9D3U0 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Pus10Q9D3U0 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Pus10Q9D3U0 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Pus10Q9D3U0 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Pus10Q9D3U0 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Pus10Q9D3U0 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Pus10Q9D3U0 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Pus10Q9D3U0 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Pus10Q9D3U0 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Pus10Q9D3U0 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Pus10Q9D3U0 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Pus10Q9D3U0 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Pus10Q9D3U0 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Pus10Q9D3U0 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Pus10Q9D3U0 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Pus10Q9D3U0 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Pus10Q9D3U0 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Pus10Q9D3U0 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Pus10Q9D3U0 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Pus10Q9D3U0 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Pus10Q9D3U0 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Pus10Q9D3U0 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Pus10Q9D3U0 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Pus10Q9D3U0 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Pus10Q9D3U0 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Pus10Q9D3U0 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Pus10Q9D3U0 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Pus10Q9D3U0 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Pus10Q9D3U0 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Pus10Q9D3U0 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Pus10Q9D3U0 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Pus10Q9D3U0 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Pus10Q9D3U0 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Pus10Q9D3U0 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Pus10Q9D3U0 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Pus10Q9D3U0 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Pus10Q9D3U0 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Pus10Q9D3U0 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Pus10Q9D3U0 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Pus10Q9D3U0 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Pus10Q9D3U0 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Pus10Q9D3U0 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Pus10Q9D3U0 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Pus10Q9D3U0 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Pus10Q9D3U0 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Pus10Q9D3U0 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Pus10Q9D3U0 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Pus10Q9D3U0 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Pus10Q9D3U0 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Pus10Q9D3U0 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Pus10Q9D3U0 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Pus10Q9D3U0 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Pus10Q9D3U0 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Pus10Q9D3U0 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Pus10Q9D3U0 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Pus10Q9D3U0 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Pus10Q9D3U0 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Pus10Q9D3U0 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Pus10Q9D3U0 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
Pus10Q9D3U0 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
Pus10Q9D3U0 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Pus10Q9D3U0 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Pus10Q9D3U0 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Pus10Q9D3U0 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Pus10Q9D3U0 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Pus10Q9D3U0 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Pus10Q9D3U0 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Pus10Q9D3U0 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Pus10Q9D3U0 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Pus10Q9D3U0 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Pus10Q9D3U0 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Pus10Q9D3U0 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Pus10Q9D3U0 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Pus10Q9D3U0 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Pus10Q9D3U0 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Pus10Q9D3U0 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Pus10Q9D3U0 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Pus10Q9D3U0 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Pus10Q9D3U0 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Pus10Q9D3U0 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Pus10Q9D3U0 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Pus10Q9D3U0 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Pus10Q9D3U0 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Pus10Q9D3U0 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Pus10Q9D3U0 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Pus10Q9D3U0 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Pus10Q9D3U0 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Pus10Q9D3U0 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Pus10Q9D3U0 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Pus10Q9D3U0 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Pus10Q9D3U0 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Pus10Q9D3U0 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Pus10Q9D3U0 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Pus10Q9D3U0 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Pus10Q9D3U0 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Pus10Q9D3U0 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Pus10Q9D3U0 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms