Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2F1

Pramef12, PRAME family member 12, mousemouse

Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramef12Q9D2F1 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Pramef12Q9D2F1 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Pramef12Q9D2F1 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Pramef12Q9D2F1 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Pramef12Q9D2F1 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Pramef12Q9D2F1 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Pramef12Q9D2F1 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Pramef12Q9D2F1 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Pramef12Q9D2F1 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Pramef12Q9D2F1 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Pramef12Q9D2F1 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
Pramef12Q9D2F1 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Pramef12Q9D2F1 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Pramef12Q9D2F1 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Pramef12Q9D2F1 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Pramef12Q9D2F1 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Pramef12Q9D2F1 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Pramef12Q9D2F1 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Pramef12Q9D2F1 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
Pramef12Q9D2F1 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Pramef12Q9D2F1 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Pramef12Q9D2F1 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Pramef12Q9D2F1 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Pramef12Q9D2F1 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
Pramef12Q9D2F1 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Pramef12Q9D2F1 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Pramef12Q9D2F1 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Pramef12Q9D2F1 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Pramef12Q9D2F1 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
Pramef12Q9D2F1 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Pramef12Q9D2F1 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Pramef12Q9D2F1 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Pramef12Q9D2F1 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Pramef12Q9D2F1 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Pramef12Q9D2F1 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Pramef12Q9D2F1 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Pramef12Q9D2F1 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Pramef12Q9D2F1 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Pramef12Q9D2F1 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Pramef12Q9D2F1 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Pramef12Q9D2F1 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Pramef12Q9D2F1 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Pramef12Q9D2F1 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Pramef12Q9D2F1 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Pramef12Q9D2F1 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Pramef12Q9D2F1 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Pramef12Q9D2F1 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Pramef12Q9D2F1 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Pramef12Q9D2F1 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Pramef12Q9D2F1 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Pramef12Q9D2F1 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Pramef12Q9D2F1 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Pramef12Q9D2F1 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Pramef12Q9D2F1 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Pramef12Q9D2F1 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Pramef12Q9D2F1 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Pramef12Q9D2F1 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Pramef12Q9D2F1 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
Pramef12Q9D2F1 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Pramef12Q9D2F1 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
Pramef12Q9D2F1 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
Pramef12Q9D2F1 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
Pramef12Q9D2F1 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Pramef12Q9D2F1 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
Pramef12Q9D2F1 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
Pramef12Q9D2F1 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
Pramef12Q9D2F1 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
Pramef12Q9D2F1 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Pramef12Q9D2F1 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Pramef12Q9D2F1 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Pramef12Q9D2F1 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Pramef12Q9D2F1 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Pramef12Q9D2F1 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Pramef12Q9D2F1 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Pramef12Q9D2F1 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Pramef12Q9D2F1 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Pramef12Q9D2F1 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Pramef12Q9D2F1 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Pramef12Q9D2F1 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Pramef12Q9D2F1 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Pramef12Q9D2F1 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Pramef12Q9D2F1 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Pramef12Q9D2F1 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Pramef12Q9D2F1 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Pramef12Q9D2F1 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Pramef12Q9D2F1 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Pramef12Q9D2F1 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Pramef12Q9D2F1 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Pramef12Q9D2F1 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Pramef12Q9D2F1 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Pramef12Q9D2F1 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Pramef12Q9D2F1 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Pramef12Q9D2F1 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Pramef12Q9D2F1 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.91
Pramef12Q9D2F1 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Pramef12Q9D2F1 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Pramef12Q9D2F1 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Pramef12Q9D2F1 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Pramef12Q9D2F1 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Pramef12Q9D2F1 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.7 ms