Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1E5

Lmbr1l, Protein LMBR1L, mousemouse

Predictions only

Length 489 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmbr1lQ9D1E5 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Lmbr1lQ9D1E5 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Lmbr1lQ9D1E5 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Lmbr1lQ9D1E5 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Lmbr1lQ9D1E5 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Lmbr1lQ9D1E5 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Lmbr1lQ9D1E5 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Lmbr1lQ9D1E5 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Lmbr1lQ9D1E5 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Lmbr1lQ9D1E5 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Lmbr1lQ9D1E5 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Lmbr1lQ9D1E5 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Lmbr1lQ9D1E5 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Lmbr1lQ9D1E5 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Lmbr1lQ9D1E5 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Lmbr1lQ9D1E5 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Lmbr1lQ9D1E5 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Lmbr1lQ9D1E5 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Lmbr1lQ9D1E5 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Lmbr1lQ9D1E5 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Lmbr1lQ9D1E5 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Lmbr1lQ9D1E5 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Lmbr1lQ9D1E5 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Lmbr1lQ9D1E5 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Lmbr1lQ9D1E5 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Lmbr1lQ9D1E5 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Lmbr1lQ9D1E5 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Lmbr1lQ9D1E5 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Lmbr1lQ9D1E5 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Lmbr1lQ9D1E5 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Lmbr1lQ9D1E5 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Lmbr1lQ9D1E5 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Lmbr1lQ9D1E5 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Lmbr1lQ9D1E5 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Lmbr1lQ9D1E5 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Lmbr1lQ9D1E5 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Lmbr1lQ9D1E5 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Lmbr1lQ9D1E5 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Lmbr1lQ9D1E5 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Lmbr1lQ9D1E5 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Lmbr1lQ9D1E5 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Lmbr1lQ9D1E5 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Lmbr1lQ9D1E5 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Lmbr1lQ9D1E5 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Lmbr1lQ9D1E5 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Lmbr1lQ9D1E5 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Lmbr1lQ9D1E5 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Lmbr1lQ9D1E5 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Lmbr1lQ9D1E5 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Lmbr1lQ9D1E5 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Lmbr1lQ9D1E5 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Lmbr1lQ9D1E5 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Lmbr1lQ9D1E5 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Lmbr1lQ9D1E5 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Lmbr1lQ9D1E5 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Lmbr1lQ9D1E5 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Lmbr1lQ9D1E5 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Lmbr1lQ9D1E5 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Lmbr1lQ9D1E5 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Lmbr1lQ9D1E5 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Lmbr1lQ9D1E5 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Lmbr1lQ9D1E5 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Lmbr1lQ9D1E5 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Lmbr1lQ9D1E5 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Lmbr1lQ9D1E5 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Lmbr1lQ9D1E5 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Lmbr1lQ9D1E5 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Lmbr1lQ9D1E5 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Lmbr1lQ9D1E5 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Lmbr1lQ9D1E5 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Lmbr1lQ9D1E5 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Lmbr1lQ9D1E5 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Lmbr1lQ9D1E5 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Lmbr1lQ9D1E5 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Lmbr1lQ9D1E5 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Lmbr1lQ9D1E5 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Lmbr1lQ9D1E5 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Lmbr1lQ9D1E5 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Lmbr1lQ9D1E5 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Lmbr1lQ9D1E5 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Lmbr1lQ9D1E5 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Lmbr1lQ9D1E5 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Lmbr1lQ9D1E5 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Lmbr1lQ9D1E5 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Lmbr1lQ9D1E5 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Lmbr1lQ9D1E5 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Lmbr1lQ9D1E5 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Lmbr1lQ9D1E5 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Lmbr1lQ9D1E5 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Lmbr1lQ9D1E5 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Lmbr1lQ9D1E5 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Lmbr1lQ9D1E5 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Lmbr1lQ9D1E5 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Lmbr1lQ9D1E5 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Lmbr1lQ9D1E5 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Lmbr1lQ9D1E5 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Lmbr1lQ9D1E5 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Lmbr1lQ9D1E5 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Lmbr1lQ9D1E5 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Lmbr1lQ9D1E5 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms