Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZX0

Elp3, Elongator complex protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 547 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Elp3Q9CZX0 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Elp3Q9CZX0 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Elp3Q9CZX0 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Elp3Q9CZX0 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Elp3Q9CZX0 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Elp3Q9CZX0 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Elp3Q9CZX0 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Elp3Q9CZX0 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Elp3Q9CZX0 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Elp3Q9CZX0 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Elp3Q9CZX0 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Elp3Q9CZX0 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Elp3Q9CZX0 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Elp3Q9CZX0 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Elp3Q9CZX0 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Elp3Q9CZX0 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Elp3Q9CZX0 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Elp3Q9CZX0 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Elp3Q9CZX0 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Elp3Q9CZX0 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Elp3Q9CZX0 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Elp3Q9CZX0 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Elp3Q9CZX0 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Elp3Q9CZX0 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Elp3Q9CZX0 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Elp3Q9CZX0 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Elp3Q9CZX0 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Elp3Q9CZX0 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Elp3Q9CZX0 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Elp3Q9CZX0 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Elp3Q9CZX0 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Elp3Q9CZX0 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Elp3Q9CZX0 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Elp3Q9CZX0 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Elp3Q9CZX0 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Elp3Q9CZX0 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Elp3Q9CZX0 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Elp3Q9CZX0 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Elp3Q9CZX0 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Elp3Q9CZX0 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Elp3Q9CZX0 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Elp3Q9CZX0 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Elp3Q9CZX0 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Elp3Q9CZX0 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Elp3Q9CZX0 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Elp3Q9CZX0 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Elp3Q9CZX0 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Elp3Q9CZX0 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Elp3Q9CZX0 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Elp3Q9CZX0 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Elp3Q9CZX0 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Elp3Q9CZX0 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Elp3Q9CZX0 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Elp3Q9CZX0 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Elp3Q9CZX0 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Elp3Q9CZX0 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Elp3Q9CZX0 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Elp3Q9CZX0 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Elp3Q9CZX0 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Elp3Q9CZX0 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Elp3Q9CZX0 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Elp3Q9CZX0 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Elp3Q9CZX0 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Elp3Q9CZX0 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Elp3Q9CZX0 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Elp3Q9CZX0 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Elp3Q9CZX0 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Elp3Q9CZX0 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Elp3Q9CZX0 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Elp3Q9CZX0 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Elp3Q9CZX0 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Elp3Q9CZX0 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Elp3Q9CZX0 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Elp3Q9CZX0 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Elp3Q9CZX0 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Elp3Q9CZX0 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Elp3Q9CZX0 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Elp3Q9CZX0 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Elp3Q9CZX0 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Elp3Q9CZX0 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Elp3Q9CZX0 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Elp3Q9CZX0 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Elp3Q9CZX0 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Elp3Q9CZX0 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Elp3Q9CZX0 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Elp3Q9CZX0 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Elp3Q9CZX0 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Elp3Q9CZX0 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Elp3Q9CZX0 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Elp3Q9CZX0 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Elp3Q9CZX0 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Elp3Q9CZX0 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Elp3Q9CZX0 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Elp3Q9CZX0 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Elp3Q9CZX0 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Elp3Q9CZX0 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Elp3Q9CZX0 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Elp3Q9CZX0 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Elp3Q9CZX0 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Elp3Q9CZX0 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
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