Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXP9

Exo5, Exonuclease V, mousemouse

Predictions only

Length 373 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Exo5Q9CXP9 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Exo5Q9CXP9 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Exo5Q9CXP9 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Exo5Q9CXP9 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Exo5Q9CXP9 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Exo5Q9CXP9 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Exo5Q9CXP9 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Exo5Q9CXP9 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Exo5Q9CXP9 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Exo5Q9CXP9 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Exo5Q9CXP9 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Exo5Q9CXP9 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Exo5Q9CXP9 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Exo5Q9CXP9 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Exo5Q9CXP9 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Exo5Q9CXP9 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Exo5Q9CXP9 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Exo5Q9CXP9 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Exo5Q9CXP9 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Exo5Q9CXP9 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Exo5Q9CXP9 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Exo5Q9CXP9 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Exo5Q9CXP9 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Exo5Q9CXP9 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Exo5Q9CXP9 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Exo5Q9CXP9 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Exo5Q9CXP9 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Exo5Q9CXP9 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Exo5Q9CXP9 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Exo5Q9CXP9 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Exo5Q9CXP9 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Exo5Q9CXP9 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Exo5Q9CXP9 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Exo5Q9CXP9 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Exo5Q9CXP9 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Exo5Q9CXP9 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Exo5Q9CXP9 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Exo5Q9CXP9 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Exo5Q9CXP9 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Exo5Q9CXP9 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Exo5Q9CXP9 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Exo5Q9CXP9 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Exo5Q9CXP9 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Exo5Q9CXP9 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Exo5Q9CXP9 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Exo5Q9CXP9 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Exo5Q9CXP9 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Exo5Q9CXP9 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Exo5Q9CXP9 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Exo5Q9CXP9 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Exo5Q9CXP9 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Exo5Q9CXP9 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Exo5Q9CXP9 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Exo5Q9CXP9 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Exo5Q9CXP9 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Exo5Q9CXP9 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Exo5Q9CXP9 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Exo5Q9CXP9 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Exo5Q9CXP9 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Exo5Q9CXP9 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Exo5Q9CXP9 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Exo5Q9CXP9 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Exo5Q9CXP9 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Exo5Q9CXP9 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Exo5Q9CXP9 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Exo5Q9CXP9 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Exo5Q9CXP9 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Exo5Q9CXP9 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Exo5Q9CXP9 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Exo5Q9CXP9 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Exo5Q9CXP9 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Exo5Q9CXP9 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Exo5Q9CXP9 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Exo5Q9CXP9 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Exo5Q9CXP9 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Exo5Q9CXP9 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Exo5Q9CXP9 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Exo5Q9CXP9 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Exo5Q9CXP9 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Exo5Q9CXP9 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Exo5Q9CXP9 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Exo5Q9CXP9 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Exo5Q9CXP9 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Exo5Q9CXP9 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Exo5Q9CXP9 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Exo5Q9CXP9 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Exo5Q9CXP9 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Exo5Q9CXP9 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Exo5Q9CXP9 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Exo5Q9CXP9 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Exo5Q9CXP9 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Exo5Q9CXP9 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Exo5Q9CXP9 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Exo5Q9CXP9 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Exo5Q9CXP9 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Exo5Q9CXP9 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Exo5Q9CXP9 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Exo5Q9CXP9 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Exo5Q9CXP9 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Exo5Q9CXP9 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.1 ms