Protein–RNA interactions for Protein: Q9CX30

Yif1b, Protein YIF1B, mousemouse

Predictions only

Length 311 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Yif1bQ9CX30 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Yif1bQ9CX30 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Yif1bQ9CX30 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Yif1bQ9CX30 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Yif1bQ9CX30 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Yif1bQ9CX30 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Yif1bQ9CX30 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Yif1bQ9CX30 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Yif1bQ9CX30 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Yif1bQ9CX30 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Yif1bQ9CX30 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Yif1bQ9CX30 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Yif1bQ9CX30 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Yif1bQ9CX30 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Yif1bQ9CX30 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Yif1bQ9CX30 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Yif1bQ9CX30 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Yif1bQ9CX30 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Yif1bQ9CX30 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Yif1bQ9CX30 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Yif1bQ9CX30 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Yif1bQ9CX30 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Yif1bQ9CX30 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Yif1bQ9CX30 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Yif1bQ9CX30 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Yif1bQ9CX30 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Yif1bQ9CX30 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Yif1bQ9CX30 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Yif1bQ9CX30 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Yif1bQ9CX30 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Yif1bQ9CX30 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Yif1bQ9CX30 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Yif1bQ9CX30 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Yif1bQ9CX30 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Yif1bQ9CX30 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Yif1bQ9CX30 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Yif1bQ9CX30 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Yif1bQ9CX30 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Yif1bQ9CX30 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Yif1bQ9CX30 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Yif1bQ9CX30 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Yif1bQ9CX30 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Yif1bQ9CX30 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Yif1bQ9CX30 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Yif1bQ9CX30 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Yif1bQ9CX30 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Yif1bQ9CX30 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Yif1bQ9CX30 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Yif1bQ9CX30 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Yif1bQ9CX30 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Yif1bQ9CX30 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Yif1bQ9CX30 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Yif1bQ9CX30 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Yif1bQ9CX30 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Yif1bQ9CX30 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Yif1bQ9CX30 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Yif1bQ9CX30 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Yif1bQ9CX30 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Yif1bQ9CX30 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Yif1bQ9CX30 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Yif1bQ9CX30 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Yif1bQ9CX30 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Yif1bQ9CX30 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Yif1bQ9CX30 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Yif1bQ9CX30 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Yif1bQ9CX30 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Yif1bQ9CX30 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Yif1bQ9CX30 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Yif1bQ9CX30 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Yif1bQ9CX30 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Yif1bQ9CX30 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Yif1bQ9CX30 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Yif1bQ9CX30 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Yif1bQ9CX30 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Yif1bQ9CX30 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Yif1bQ9CX30 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Yif1bQ9CX30 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Yif1bQ9CX30 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Yif1bQ9CX30 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Yif1bQ9CX30 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Yif1bQ9CX30 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Yif1bQ9CX30 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Yif1bQ9CX30 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Yif1bQ9CX30 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Yif1bQ9CX30 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Yif1bQ9CX30 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Yif1bQ9CX30 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Yif1bQ9CX30 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Yif1bQ9CX30 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Yif1bQ9CX30 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Yif1bQ9CX30 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Yif1bQ9CX30 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Yif1bQ9CX30 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Yif1bQ9CX30 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Yif1bQ9CX30 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Yif1bQ9CX30 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Yif1bQ9CX30 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Yif1bQ9CX30 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Yif1bQ9CX30 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Yif1bQ9CX30 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms