Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWN7

Cnot11, CCR4-NOT transcription complex subunit 11, mousemouse

Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot11Q9CWN7 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cnot11Q9CWN7 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cnot11Q9CWN7 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cnot11Q9CWN7 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cnot11Q9CWN7 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cnot11Q9CWN7 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cnot11Q9CWN7 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cnot11Q9CWN7 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cnot11Q9CWN7 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cnot11Q9CWN7 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cnot11Q9CWN7 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cnot11Q9CWN7 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cnot11Q9CWN7 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cnot11Q9CWN7 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cnot11Q9CWN7 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cnot11Q9CWN7 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cnot11Q9CWN7 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cnot11Q9CWN7 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Cnot11Q9CWN7 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cnot11Q9CWN7 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cnot11Q9CWN7 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cnot11Q9CWN7 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cnot11Q9CWN7 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cnot11Q9CWN7 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cnot11Q9CWN7 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cnot11Q9CWN7 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cnot11Q9CWN7 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Cnot11Q9CWN7 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Cnot11Q9CWN7 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cnot11Q9CWN7 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cnot11Q9CWN7 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cnot11Q9CWN7 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cnot11Q9CWN7 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cnot11Q9CWN7 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Cnot11Q9CWN7 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cnot11Q9CWN7 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cnot11Q9CWN7 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cnot11Q9CWN7 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cnot11Q9CWN7 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cnot11Q9CWN7 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cnot11Q9CWN7 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cnot11Q9CWN7 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cnot11Q9CWN7 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cnot11Q9CWN7 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cnot11Q9CWN7 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cnot11Q9CWN7 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cnot11Q9CWN7 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cnot11Q9CWN7 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cnot11Q9CWN7 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cnot11Q9CWN7 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cnot11Q9CWN7 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cnot11Q9CWN7 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cnot11Q9CWN7 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Cnot11Q9CWN7 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cnot11Q9CWN7 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cnot11Q9CWN7 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cnot11Q9CWN7 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cnot11Q9CWN7 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Cnot11Q9CWN7 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cnot11Q9CWN7 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cnot11Q9CWN7 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cnot11Q9CWN7 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cnot11Q9CWN7 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cnot11Q9CWN7 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cnot11Q9CWN7 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cnot11Q9CWN7 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cnot11Q9CWN7 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cnot11Q9CWN7 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cnot11Q9CWN7 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Cnot11Q9CWN7 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cnot11Q9CWN7 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cnot11Q9CWN7 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cnot11Q9CWN7 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cnot11Q9CWN7 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Cnot11Q9CWN7 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cnot11Q9CWN7 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cnot11Q9CWN7 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cnot11Q9CWN7 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cnot11Q9CWN7 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cnot11Q9CWN7 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cnot11Q9CWN7 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cnot11Q9CWN7 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Cnot11Q9CWN7 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cnot11Q9CWN7 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cnot11Q9CWN7 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cnot11Q9CWN7 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cnot11Q9CWN7 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cnot11Q9CWN7 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cnot11Q9CWN7 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cnot11Q9CWN7 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cnot11Q9CWN7 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cnot11Q9CWN7 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cnot11Q9CWN7 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cnot11Q9CWN7 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cnot11Q9CWN7 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cnot11Q9CWN7 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cnot11Q9CWN7 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cnot11Q9CWN7 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cnot11Q9CWN7 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cnot11Q9CWN7 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 254.8 ms