Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWI3

Bccip, BRCA2 and CDKN1A-interacting protein, mousemouse

Predictions only

Length 316 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BccipQ9CWI3 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
BccipQ9CWI3 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
BccipQ9CWI3 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
BccipQ9CWI3 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
BccipQ9CWI3 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
BccipQ9CWI3 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
BccipQ9CWI3 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
BccipQ9CWI3 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
BccipQ9CWI3 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
BccipQ9CWI3 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
BccipQ9CWI3 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
BccipQ9CWI3 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
BccipQ9CWI3 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
BccipQ9CWI3 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
BccipQ9CWI3 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
BccipQ9CWI3 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
BccipQ9CWI3 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
BccipQ9CWI3 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
BccipQ9CWI3 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
BccipQ9CWI3 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
BccipQ9CWI3 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
BccipQ9CWI3 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
BccipQ9CWI3 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
BccipQ9CWI3 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
BccipQ9CWI3 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
BccipQ9CWI3 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
BccipQ9CWI3 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
BccipQ9CWI3 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
BccipQ9CWI3 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
BccipQ9CWI3 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
BccipQ9CWI3 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
BccipQ9CWI3 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
BccipQ9CWI3 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
BccipQ9CWI3 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
BccipQ9CWI3 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
BccipQ9CWI3 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
BccipQ9CWI3 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
BccipQ9CWI3 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
BccipQ9CWI3 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
BccipQ9CWI3 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
BccipQ9CWI3 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
BccipQ9CWI3 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
BccipQ9CWI3 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
BccipQ9CWI3 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
BccipQ9CWI3 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
BccipQ9CWI3 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
BccipQ9CWI3 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
BccipQ9CWI3 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
BccipQ9CWI3 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
BccipQ9CWI3 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
BccipQ9CWI3 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
BccipQ9CWI3 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
BccipQ9CWI3 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
BccipQ9CWI3 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
BccipQ9CWI3 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
BccipQ9CWI3 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
BccipQ9CWI3 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
BccipQ9CWI3 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
BccipQ9CWI3 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
BccipQ9CWI3 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
BccipQ9CWI3 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
BccipQ9CWI3 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
BccipQ9CWI3 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
BccipQ9CWI3 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
BccipQ9CWI3 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
BccipQ9CWI3 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
BccipQ9CWI3 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
BccipQ9CWI3 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
BccipQ9CWI3 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
BccipQ9CWI3 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
BccipQ9CWI3 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
BccipQ9CWI3 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
BccipQ9CWI3 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
BccipQ9CWI3 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
BccipQ9CWI3 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
BccipQ9CWI3 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
BccipQ9CWI3 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
BccipQ9CWI3 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
BccipQ9CWI3 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
BccipQ9CWI3 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
BccipQ9CWI3 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
BccipQ9CWI3 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
BccipQ9CWI3 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
BccipQ9CWI3 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
BccipQ9CWI3 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
BccipQ9CWI3 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
BccipQ9CWI3 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
BccipQ9CWI3 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
BccipQ9CWI3 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
BccipQ9CWI3 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
BccipQ9CWI3 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
BccipQ9CWI3 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
BccipQ9CWI3 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
BccipQ9CWI3 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
BccipQ9CWI3 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
BccipQ9CWI3 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
BccipQ9CWI3 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
BccipQ9CWI3 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
BccipQ9CWI3 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
BccipQ9CWI3 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
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