Protein–RNA interactions for Protein: Q9CS72

Filip1, Filamin-A-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,211 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Filip1Q9CS72 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Filip1Q9CS72 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Filip1Q9CS72 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Filip1Q9CS72 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Filip1Q9CS72 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Filip1Q9CS72 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Filip1Q9CS72 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Filip1Q9CS72 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Filip1Q9CS72 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Filip1Q9CS72 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Filip1Q9CS72 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Filip1Q9CS72 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Filip1Q9CS72 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Filip1Q9CS72 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Filip1Q9CS72 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Filip1Q9CS72 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Filip1Q9CS72 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Filip1Q9CS72 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Filip1Q9CS72 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Filip1Q9CS72 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Filip1Q9CS72 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Filip1Q9CS72 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Filip1Q9CS72 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Filip1Q9CS72 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Filip1Q9CS72 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Filip1Q9CS72 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Filip1Q9CS72 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Filip1Q9CS72 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Filip1Q9CS72 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Filip1Q9CS72 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Filip1Q9CS72 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Filip1Q9CS72 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Filip1Q9CS72 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Filip1Q9CS72 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Filip1Q9CS72 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Filip1Q9CS72 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Filip1Q9CS72 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Filip1Q9CS72 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Filip1Q9CS72 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Filip1Q9CS72 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Filip1Q9CS72 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Filip1Q9CS72 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Filip1Q9CS72 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Filip1Q9CS72 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Filip1Q9CS72 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Filip1Q9CS72 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Filip1Q9CS72 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Filip1Q9CS72 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Filip1Q9CS72 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Filip1Q9CS72 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Filip1Q9CS72 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Filip1Q9CS72 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Filip1Q9CS72 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Filip1Q9CS72 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Filip1Q9CS72 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Filip1Q9CS72 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Filip1Q9CS72 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Filip1Q9CS72 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Filip1Q9CS72 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Filip1Q9CS72 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Filip1Q9CS72 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Filip1Q9CS72 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Filip1Q9CS72 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Filip1Q9CS72 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Filip1Q9CS72 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Filip1Q9CS72 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Filip1Q9CS72 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Filip1Q9CS72 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Filip1Q9CS72 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Filip1Q9CS72 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Filip1Q9CS72 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Filip1Q9CS72 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Filip1Q9CS72 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Filip1Q9CS72 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Filip1Q9CS72 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Filip1Q9CS72 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Filip1Q9CS72 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Filip1Q9CS72 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Filip1Q9CS72 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Filip1Q9CS72 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Filip1Q9CS72 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Filip1Q9CS72 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Filip1Q9CS72 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Filip1Q9CS72 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Filip1Q9CS72 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Filip1Q9CS72 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Filip1Q9CS72 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Filip1Q9CS72 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Filip1Q9CS72 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Filip1Q9CS72 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Filip1Q9CS72 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Filip1Q9CS72 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Filip1Q9CS72 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Filip1Q9CS72 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Filip1Q9CS72 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Filip1Q9CS72 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Filip1Q9CS72 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Filip1Q9CS72 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Filip1Q9CS72 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Filip1Q9CS72 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms