Protein–RNA interactions for Protein: Q9CRB9

Chchd3, MICOS complex subunit Mic19, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chchd3Q9CRB9 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Chchd3Q9CRB9 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Chchd3Q9CRB9 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Chchd3Q9CRB9 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Chchd3Q9CRB9 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Chchd3Q9CRB9 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Chchd3Q9CRB9 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Chchd3Q9CRB9 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Chchd3Q9CRB9 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Chchd3Q9CRB9 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Chchd3Q9CRB9 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Chchd3Q9CRB9 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Chchd3Q9CRB9 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Chchd3Q9CRB9 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Chchd3Q9CRB9 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Chchd3Q9CRB9 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Chchd3Q9CRB9 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Chchd3Q9CRB9 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Chchd3Q9CRB9 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Chchd3Q9CRB9 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Chchd3Q9CRB9 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Chchd3Q9CRB9 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Chchd3Q9CRB9 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Chchd3Q9CRB9 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Chchd3Q9CRB9 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Chchd3Q9CRB9 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Chchd3Q9CRB9 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Chchd3Q9CRB9 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Chchd3Q9CRB9 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Chchd3Q9CRB9 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Chchd3Q9CRB9 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Chchd3Q9CRB9 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Chchd3Q9CRB9 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Chchd3Q9CRB9 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Chchd3Q9CRB9 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Chchd3Q9CRB9 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Chchd3Q9CRB9 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Chchd3Q9CRB9 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Chchd3Q9CRB9 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Chchd3Q9CRB9 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Chchd3Q9CRB9 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Chchd3Q9CRB9 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Chchd3Q9CRB9 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Chchd3Q9CRB9 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Chchd3Q9CRB9 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Chchd3Q9CRB9 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Chchd3Q9CRB9 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Chchd3Q9CRB9 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Chchd3Q9CRB9 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Chchd3Q9CRB9 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Chchd3Q9CRB9 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Chchd3Q9CRB9 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Chchd3Q9CRB9 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Chchd3Q9CRB9 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Chchd3Q9CRB9 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Chchd3Q9CRB9 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Chchd3Q9CRB9 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Chchd3Q9CRB9 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Chchd3Q9CRB9 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Chchd3Q9CRB9 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Chchd3Q9CRB9 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Chchd3Q9CRB9 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Chchd3Q9CRB9 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Chchd3Q9CRB9 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Chchd3Q9CRB9 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Chchd3Q9CRB9 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Chchd3Q9CRB9 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Chchd3Q9CRB9 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Chchd3Q9CRB9 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Chchd3Q9CRB9 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Chchd3Q9CRB9 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Chchd3Q9CRB9 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Chchd3Q9CRB9 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Chchd3Q9CRB9 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Chchd3Q9CRB9 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Chchd3Q9CRB9 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Chchd3Q9CRB9 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Chchd3Q9CRB9 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Chchd3Q9CRB9 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Chchd3Q9CRB9 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Chchd3Q9CRB9 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Chchd3Q9CRB9 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Chchd3Q9CRB9 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Chchd3Q9CRB9 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Chchd3Q9CRB9 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Chchd3Q9CRB9 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Chchd3Q9CRB9 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Chchd3Q9CRB9 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Chchd3Q9CRB9 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Chchd3Q9CRB9 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Chchd3Q9CRB9 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Chchd3Q9CRB9 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Chchd3Q9CRB9 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Chchd3Q9CRB9 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Chchd3Q9CRB9 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Chchd3Q9CRB9 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Chchd3Q9CRB9 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Chchd3Q9CRB9 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Chchd3Q9CRB9 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Chchd3Q9CRB9 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms