Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQT5

Pomp, Proteasome maturation protein, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PompQ9CQT5 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PompQ9CQT5 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
PompQ9CQT5 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
PompQ9CQT5 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PompQ9CQT5 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PompQ9CQT5 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
PompQ9CQT5 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
PompQ9CQT5 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PompQ9CQT5 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PompQ9CQT5 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PompQ9CQT5 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PompQ9CQT5 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PompQ9CQT5 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PompQ9CQT5 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PompQ9CQT5 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PompQ9CQT5 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PompQ9CQT5 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PompQ9CQT5 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
PompQ9CQT5 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
PompQ9CQT5 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PompQ9CQT5 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PompQ9CQT5 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PompQ9CQT5 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PompQ9CQT5 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PompQ9CQT5 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
PompQ9CQT5 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PompQ9CQT5 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PompQ9CQT5 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PompQ9CQT5 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PompQ9CQT5 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
PompQ9CQT5 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PompQ9CQT5 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PompQ9CQT5 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PompQ9CQT5 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PompQ9CQT5 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PompQ9CQT5 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PompQ9CQT5 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PompQ9CQT5 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PompQ9CQT5 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PompQ9CQT5 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PompQ9CQT5 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PompQ9CQT5 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PompQ9CQT5 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PompQ9CQT5 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PompQ9CQT5 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
PompQ9CQT5 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PompQ9CQT5 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PompQ9CQT5 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PompQ9CQT5 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PompQ9CQT5 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
PompQ9CQT5 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PompQ9CQT5 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PompQ9CQT5 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PompQ9CQT5 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PompQ9CQT5 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PompQ9CQT5 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PompQ9CQT5 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PompQ9CQT5 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PompQ9CQT5 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PompQ9CQT5 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PompQ9CQT5 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PompQ9CQT5 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PompQ9CQT5 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PompQ9CQT5 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
PompQ9CQT5 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
PompQ9CQT5 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
PompQ9CQT5 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
PompQ9CQT5 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
PompQ9CQT5 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
PompQ9CQT5 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
PompQ9CQT5 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
PompQ9CQT5 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PompQ9CQT5 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
PompQ9CQT5 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
PompQ9CQT5 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PompQ9CQT5 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PompQ9CQT5 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PompQ9CQT5 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PompQ9CQT5 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PompQ9CQT5 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PompQ9CQT5 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PompQ9CQT5 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PompQ9CQT5 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PompQ9CQT5 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PompQ9CQT5 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PompQ9CQT5 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PompQ9CQT5 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
PompQ9CQT5 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PompQ9CQT5 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PompQ9CQT5 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PompQ9CQT5 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PompQ9CQT5 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PompQ9CQT5 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PompQ9CQT5 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PompQ9CQT5 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PompQ9CQT5 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PompQ9CQT5 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PompQ9CQT5 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PompQ9CQT5 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PompQ9CQT5 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.1 ms