Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQK7

Rwdd1, RWD domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rwdd1Q9CQK7 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Rwdd1Q9CQK7 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Rwdd1Q9CQK7 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Rwdd1Q9CQK7 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Rwdd1Q9CQK7 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Rwdd1Q9CQK7 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Rwdd1Q9CQK7 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Rwdd1Q9CQK7 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Rwdd1Q9CQK7 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Rwdd1Q9CQK7 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Rwdd1Q9CQK7 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Rwdd1Q9CQK7 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Rwdd1Q9CQK7 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Rwdd1Q9CQK7 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Rwdd1Q9CQK7 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Rwdd1Q9CQK7 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Rwdd1Q9CQK7 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Rwdd1Q9CQK7 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Rwdd1Q9CQK7 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Rwdd1Q9CQK7 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Rwdd1Q9CQK7 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Rwdd1Q9CQK7 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Rwdd1Q9CQK7 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Rwdd1Q9CQK7 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Rwdd1Q9CQK7 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Rwdd1Q9CQK7 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Rwdd1Q9CQK7 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Rwdd1Q9CQK7 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Rwdd1Q9CQK7 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Rwdd1Q9CQK7 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Rwdd1Q9CQK7 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Rwdd1Q9CQK7 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Rwdd1Q9CQK7 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Rwdd1Q9CQK7 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Rwdd1Q9CQK7 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Rwdd1Q9CQK7 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Rwdd1Q9CQK7 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Rwdd1Q9CQK7 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Rwdd1Q9CQK7 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Rwdd1Q9CQK7 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Rwdd1Q9CQK7 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Rwdd1Q9CQK7 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Rwdd1Q9CQK7 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Rwdd1Q9CQK7 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Rwdd1Q9CQK7 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Rwdd1Q9CQK7 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Rwdd1Q9CQK7 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Rwdd1Q9CQK7 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Rwdd1Q9CQK7 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Rwdd1Q9CQK7 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Rwdd1Q9CQK7 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Rwdd1Q9CQK7 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Rwdd1Q9CQK7 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Rwdd1Q9CQK7 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Rwdd1Q9CQK7 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Rwdd1Q9CQK7 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Rwdd1Q9CQK7 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Rwdd1Q9CQK7 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Rwdd1Q9CQK7 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Rwdd1Q9CQK7 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Rwdd1Q9CQK7 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Rwdd1Q9CQK7 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Rwdd1Q9CQK7 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Rwdd1Q9CQK7 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Rwdd1Q9CQK7 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Rwdd1Q9CQK7 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Rwdd1Q9CQK7 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Rwdd1Q9CQK7 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Rwdd1Q9CQK7 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Rwdd1Q9CQK7 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Rwdd1Q9CQK7 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Rwdd1Q9CQK7 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Rwdd1Q9CQK7 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Rwdd1Q9CQK7 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Rwdd1Q9CQK7 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Rwdd1Q9CQK7 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Rwdd1Q9CQK7 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Rwdd1Q9CQK7 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Rwdd1Q9CQK7 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Rwdd1Q9CQK7 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Rwdd1Q9CQK7 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Rwdd1Q9CQK7 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Rwdd1Q9CQK7 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Rwdd1Q9CQK7 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Rwdd1Q9CQK7 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Rwdd1Q9CQK7 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Rwdd1Q9CQK7 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Rwdd1Q9CQK7 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Rwdd1Q9CQK7 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Rwdd1Q9CQK7 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
Rwdd1Q9CQK7 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Rwdd1Q9CQK7 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Rwdd1Q9CQK7 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Rwdd1Q9CQK7 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Rwdd1Q9CQK7 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Rwdd1Q9CQK7 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Rwdd1Q9CQK7 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Rwdd1Q9CQK7 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Rwdd1Q9CQK7 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Rwdd1Q9CQK7 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.6 ms