Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQE1

Nipsnap3b, Protein NipSnap homolog 3B, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nipsnap3bQ9CQE1 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Nipsnap3bQ9CQE1 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Nipsnap3bQ9CQE1 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Nipsnap3bQ9CQE1 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Nipsnap3bQ9CQE1 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Nipsnap3bQ9CQE1 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Nipsnap3bQ9CQE1 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Nipsnap3bQ9CQE1 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Nipsnap3bQ9CQE1 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Nipsnap3bQ9CQE1 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Nipsnap3bQ9CQE1 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Nipsnap3bQ9CQE1 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Nipsnap3bQ9CQE1 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Nipsnap3bQ9CQE1 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Nipsnap3bQ9CQE1 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Nipsnap3bQ9CQE1 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Nipsnap3bQ9CQE1 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Nipsnap3bQ9CQE1 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Nipsnap3bQ9CQE1 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Nipsnap3bQ9CQE1 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Nipsnap3bQ9CQE1 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Nipsnap3bQ9CQE1 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Nipsnap3bQ9CQE1 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Nipsnap3bQ9CQE1 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Nipsnap3bQ9CQE1 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Nipsnap3bQ9CQE1 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Nipsnap3bQ9CQE1 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Nipsnap3bQ9CQE1 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Nipsnap3bQ9CQE1 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Nipsnap3bQ9CQE1 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Nipsnap3bQ9CQE1 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Nipsnap3bQ9CQE1 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Nipsnap3bQ9CQE1 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Nipsnap3bQ9CQE1 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Nipsnap3bQ9CQE1 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Nipsnap3bQ9CQE1 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Nipsnap3bQ9CQE1 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Nipsnap3bQ9CQE1 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Nipsnap3bQ9CQE1 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Nipsnap3bQ9CQE1 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Nipsnap3bQ9CQE1 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Nipsnap3bQ9CQE1 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Nipsnap3bQ9CQE1 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Nipsnap3bQ9CQE1 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Nipsnap3bQ9CQE1 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Nipsnap3bQ9CQE1 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Nipsnap3bQ9CQE1 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Nipsnap3bQ9CQE1 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Nipsnap3bQ9CQE1 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Nipsnap3bQ9CQE1 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Nipsnap3bQ9CQE1 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Nipsnap3bQ9CQE1 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Nipsnap3bQ9CQE1 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Nipsnap3bQ9CQE1 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Nipsnap3bQ9CQE1 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Nipsnap3bQ9CQE1 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Nipsnap3bQ9CQE1 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Nipsnap3bQ9CQE1 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Nipsnap3bQ9CQE1 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Nipsnap3bQ9CQE1 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Nipsnap3bQ9CQE1 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Nipsnap3bQ9CQE1 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Nipsnap3bQ9CQE1 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Nipsnap3bQ9CQE1 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Nipsnap3bQ9CQE1 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Nipsnap3bQ9CQE1 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Nipsnap3bQ9CQE1 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Nipsnap3bQ9CQE1 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Nipsnap3bQ9CQE1 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Nipsnap3bQ9CQE1 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Nipsnap3bQ9CQE1 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Nipsnap3bQ9CQE1 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Nipsnap3bQ9CQE1 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Nipsnap3bQ9CQE1 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Nipsnap3bQ9CQE1 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Nipsnap3bQ9CQE1 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Nipsnap3bQ9CQE1 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Nipsnap3bQ9CQE1 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Nipsnap3bQ9CQE1 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Nipsnap3bQ9CQE1 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Nipsnap3bQ9CQE1 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Nipsnap3bQ9CQE1 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Nipsnap3bQ9CQE1 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Nipsnap3bQ9CQE1 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Nipsnap3bQ9CQE1 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Nipsnap3bQ9CQE1 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Nipsnap3bQ9CQE1 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Nipsnap3bQ9CQE1 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Nipsnap3bQ9CQE1 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Nipsnap3bQ9CQE1 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Nipsnap3bQ9CQE1 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Nipsnap3bQ9CQE1 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Nipsnap3bQ9CQE1 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53 ms