Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ90

Uncharacterized protein C9orf85 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 155 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9CQ90 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q9CQ90 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q9CQ90 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q9CQ90 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q9CQ90 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q9CQ90 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q9CQ90 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q9CQ90 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q9CQ90 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q9CQ90 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q9CQ90 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q9CQ90 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q9CQ90 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q9CQ90 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q9CQ90 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q9CQ90 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q9CQ90 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q9CQ90 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q9CQ90 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q9CQ90 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q9CQ90 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q9CQ90 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Q9CQ90 Gm39317-201ENSMUST00000213360 1138 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q9CQ90 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q9CQ90 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q9CQ90 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q9CQ90 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q9CQ90 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q9CQ90 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q9CQ90 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q9CQ90 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q9CQ90 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Q9CQ90 Ccl11-201ENSMUST00000000342 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q9CQ90 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q9CQ90 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q9CQ90 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q9CQ90 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q9CQ90 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q9CQ90 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q9CQ90 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q9CQ90 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Q9CQ90 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q9CQ90 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q9CQ90 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q9CQ90 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q9CQ90 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q9CQ90 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q9CQ90 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q9CQ90 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Q9CQ90 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q9CQ90 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q9CQ90 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q9CQ90 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q9CQ90 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q9CQ90 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q9CQ90 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q9CQ90 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q9CQ90 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q9CQ90 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q9CQ90 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q9CQ90 Gm37592-201ENSMUST00000192741 373 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q9CQ90 CT009764.1-201ENSMUST00000222260 483 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Q9CQ90 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q9CQ90 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q9CQ90 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q9CQ90 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q9CQ90 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q9CQ90 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q9CQ90 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q9CQ90 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q9CQ90 AC134328.1-201ENSMUST00000222693 667 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q9CQ90 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q9CQ90 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q9CQ90 Pink1-202ENSMUST00000105816 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q9CQ90 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q9CQ90 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q9CQ90 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q9CQ90 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q9CQ90 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q9CQ90 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q9CQ90 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q9CQ90 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q9CQ90 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q9CQ90 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Q9CQ90 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q9CQ90 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q9CQ90 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Q9CQ90 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q9CQ90 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q9CQ90 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q9CQ90 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q9CQ90 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q9CQ90 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q9CQ90 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q9CQ90 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q9CQ90 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q9CQ90 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q9CQ90 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q9CQ90 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q9CQ90 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms