Protein–RNA interactions for Protein: Q99PV8

Bcl11b, B-cell lymphoma/leukemia 11B, mousemouse

Predictions only

Length 884 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bcl11bQ99PV8 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Bcl11bQ99PV8 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Bcl11bQ99PV8 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Bcl11bQ99PV8 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Bcl11bQ99PV8 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Bcl11bQ99PV8 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Bcl11bQ99PV8 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Bcl11bQ99PV8 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Bcl11bQ99PV8 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
Bcl11bQ99PV8 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
Bcl11bQ99PV8 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Bcl11bQ99PV8 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Bcl11bQ99PV8 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Bcl11bQ99PV8 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Bcl11bQ99PV8 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Bcl11bQ99PV8 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Bcl11bQ99PV8 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Bcl11bQ99PV8 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Bcl11bQ99PV8 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
Bcl11bQ99PV8 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Bcl11bQ99PV8 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Bcl11bQ99PV8 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Bcl11bQ99PV8 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Bcl11bQ99PV8 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Bcl11bQ99PV8 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
Bcl11bQ99PV8 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Bcl11bQ99PV8 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Bcl11bQ99PV8 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Bcl11bQ99PV8 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Bcl11bQ99PV8 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Bcl11bQ99PV8 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Bcl11bQ99PV8 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Bcl11bQ99PV8 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Bcl11bQ99PV8 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Bcl11bQ99PV8 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Bcl11bQ99PV8 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Bcl11bQ99PV8 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Bcl11bQ99PV8 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Bcl11bQ99PV8 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Bcl11bQ99PV8 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Bcl11bQ99PV8 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
Bcl11bQ99PV8 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
Bcl11bQ99PV8 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Bcl11bQ99PV8 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
Bcl11bQ99PV8 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Bcl11bQ99PV8 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Bcl11bQ99PV8 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Bcl11bQ99PV8 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Bcl11bQ99PV8 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Bcl11bQ99PV8 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Bcl11bQ99PV8 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Bcl11bQ99PV8 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Bcl11bQ99PV8 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Bcl11bQ99PV8 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Bcl11bQ99PV8 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Bcl11bQ99PV8 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Bcl11bQ99PV8 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Bcl11bQ99PV8 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Bcl11bQ99PV8 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Bcl11bQ99PV8 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Bcl11bQ99PV8 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Bcl11bQ99PV8 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Bcl11bQ99PV8 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
Bcl11bQ99PV8 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Bcl11bQ99PV8 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
Bcl11bQ99PV8 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Bcl11bQ99PV8 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Bcl11bQ99PV8 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Bcl11bQ99PV8 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Bcl11bQ99PV8 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Bcl11bQ99PV8 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Bcl11bQ99PV8 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Bcl11bQ99PV8 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Bcl11bQ99PV8 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
Bcl11bQ99PV8 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Bcl11bQ99PV8 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Bcl11bQ99PV8 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Bcl11bQ99PV8 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Bcl11bQ99PV8 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Bcl11bQ99PV8 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
Bcl11bQ99PV8 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Bcl11bQ99PV8 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Bcl11bQ99PV8 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Bcl11bQ99PV8 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Bcl11bQ99PV8 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Bcl11bQ99PV8 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Bcl11bQ99PV8 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Bcl11bQ99PV8 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Bcl11bQ99PV8 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Bcl11bQ99PV8 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Bcl11bQ99PV8 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Bcl11bQ99PV8 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Bcl11bQ99PV8 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Bcl11bQ99PV8 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Bcl11bQ99PV8 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Bcl11bQ99PV8 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Bcl11bQ99PV8 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Bcl11bQ99PV8 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Bcl11bQ99PV8 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Bcl11bQ99PV8 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms