Protein–RNA interactions for Protein: Q99PV0

Prpf8, Pre-mRNA-processing-splicing factor 8, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,335 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf8Q99PV0 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Prpf8Q99PV0 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Prpf8Q99PV0 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Prpf8Q99PV0 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Prpf8Q99PV0 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Prpf8Q99PV0 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Prpf8Q99PV0 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Prpf8Q99PV0 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Prpf8Q99PV0 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Prpf8Q99PV0 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Prpf8Q99PV0 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Prpf8Q99PV0 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Prpf8Q99PV0 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Prpf8Q99PV0 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Prpf8Q99PV0 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Prpf8Q99PV0 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Prpf8Q99PV0 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Prpf8Q99PV0 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Prpf8Q99PV0 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Prpf8Q99PV0 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Prpf8Q99PV0 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Prpf8Q99PV0 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prpf8Q99PV0 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prpf8Q99PV0 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prpf8Q99PV0 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prpf8Q99PV0 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Prpf8Q99PV0 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prpf8Q99PV0 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prpf8Q99PV0 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prpf8Q99PV0 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prpf8Q99PV0 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prpf8Q99PV0 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prpf8Q99PV0 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prpf8Q99PV0 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prpf8Q99PV0 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Prpf8Q99PV0 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Prpf8Q99PV0 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Prpf8Q99PV0 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Prpf8Q99PV0 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Prpf8Q99PV0 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Prpf8Q99PV0 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Prpf8Q99PV0 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Prpf8Q99PV0 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Prpf8Q99PV0 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Prpf8Q99PV0 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prpf8Q99PV0 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prpf8Q99PV0 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prpf8Q99PV0 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prpf8Q99PV0 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prpf8Q99PV0 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prpf8Q99PV0 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prpf8Q99PV0 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prpf8Q99PV0 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prpf8Q99PV0 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prpf8Q99PV0 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prpf8Q99PV0 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prpf8Q99PV0 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prpf8Q99PV0 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prpf8Q99PV0 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prpf8Q99PV0 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prpf8Q99PV0 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prpf8Q99PV0 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prpf8Q99PV0 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prpf8Q99PV0 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prpf8Q99PV0 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prpf8Q99PV0 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prpf8Q99PV0 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prpf8Q99PV0 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prpf8Q99PV0 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prpf8Q99PV0 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prpf8Q99PV0 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prpf8Q99PV0 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prpf8Q99PV0 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prpf8Q99PV0 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prpf8Q99PV0 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prpf8Q99PV0 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prpf8Q99PV0 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prpf8Q99PV0 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prpf8Q99PV0 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prpf8Q99PV0 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prpf8Q99PV0 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prpf8Q99PV0 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prpf8Q99PV0 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prpf8Q99PV0 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Prpf8Q99PV0 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prpf8Q99PV0 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prpf8Q99PV0 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prpf8Q99PV0 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prpf8Q99PV0 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prpf8Q99PV0 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prpf8Q99PV0 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prpf8Q99PV0 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prpf8Q99PV0 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Prpf8Q99PV0 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prpf8Q99PV0 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prpf8Q99PV0 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prpf8Q99PV0 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prpf8Q99PV0 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prpf8Q99PV0 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prpf8Q99PV0 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms